Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQT5

Pomp, Proteasome maturation protein, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PompQ9CQT5 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PompQ9CQT5 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PompQ9CQT5 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PompQ9CQT5 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PompQ9CQT5 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PompQ9CQT5 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PompQ9CQT5 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PompQ9CQT5 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PompQ9CQT5 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PompQ9CQT5 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PompQ9CQT5 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PompQ9CQT5 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PompQ9CQT5 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PompQ9CQT5 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PompQ9CQT5 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PompQ9CQT5 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PompQ9CQT5 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PompQ9CQT5 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PompQ9CQT5 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PompQ9CQT5 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PompQ9CQT5 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PompQ9CQT5 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PompQ9CQT5 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PompQ9CQT5 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PompQ9CQT5 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PompQ9CQT5 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PompQ9CQT5 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PompQ9CQT5 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PompQ9CQT5 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PompQ9CQT5 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PompQ9CQT5 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PompQ9CQT5 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PompQ9CQT5 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PompQ9CQT5 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PompQ9CQT5 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PompQ9CQT5 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PompQ9CQT5 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PompQ9CQT5 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PompQ9CQT5 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PompQ9CQT5 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PompQ9CQT5 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PompQ9CQT5 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PompQ9CQT5 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PompQ9CQT5 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PompQ9CQT5 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PompQ9CQT5 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PompQ9CQT5 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PompQ9CQT5 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PompQ9CQT5 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PompQ9CQT5 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PompQ9CQT5 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PompQ9CQT5 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PompQ9CQT5 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PompQ9CQT5 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PompQ9CQT5 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PompQ9CQT5 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PompQ9CQT5 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PompQ9CQT5 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PompQ9CQT5 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PompQ9CQT5 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PompQ9CQT5 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PompQ9CQT5 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PompQ9CQT5 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PompQ9CQT5 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PompQ9CQT5 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PompQ9CQT5 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PompQ9CQT5 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PompQ9CQT5 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PompQ9CQT5 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PompQ9CQT5 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PompQ9CQT5 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PompQ9CQT5 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PompQ9CQT5 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PompQ9CQT5 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PompQ9CQT5 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PompQ9CQT5 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PompQ9CQT5 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PompQ9CQT5 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PompQ9CQT5 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PompQ9CQT5 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PompQ9CQT5 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PompQ9CQT5 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PompQ9CQT5 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PompQ9CQT5 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PompQ9CQT5 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PompQ9CQT5 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PompQ9CQT5 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PompQ9CQT5 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PompQ9CQT5 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PompQ9CQT5 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PompQ9CQT5 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PompQ9CQT5 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PompQ9CQT5 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PompQ9CQT5 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PompQ9CQT5 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PompQ9CQT5 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PompQ9CQT5 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PompQ9CQT5 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PompQ9CQT5 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PompQ9CQT5 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms