Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQL2

Ccer1, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccer1Q9CQL2 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccer1Q9CQL2 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccer1Q9CQL2 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccer1Q9CQL2 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ccer1Q9CQL2 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ccer1Q9CQL2 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ccer1Q9CQL2 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ccer1Q9CQL2 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ccer1Q9CQL2 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ccer1Q9CQL2 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccer1Q9CQL2 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccer1Q9CQL2 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccer1Q9CQL2 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccer1Q9CQL2 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccer1Q9CQL2 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccer1Q9CQL2 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccer1Q9CQL2 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccer1Q9CQL2 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccer1Q9CQL2 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccer1Q9CQL2 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccer1Q9CQL2 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccer1Q9CQL2 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccer1Q9CQL2 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccer1Q9CQL2 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccer1Q9CQL2 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccer1Q9CQL2 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccer1Q9CQL2 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccer1Q9CQL2 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccer1Q9CQL2 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccer1Q9CQL2 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccer1Q9CQL2 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccer1Q9CQL2 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccer1Q9CQL2 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccer1Q9CQL2 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccer1Q9CQL2 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccer1Q9CQL2 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccer1Q9CQL2 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccer1Q9CQL2 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccer1Q9CQL2 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccer1Q9CQL2 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccer1Q9CQL2 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccer1Q9CQL2 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccer1Q9CQL2 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccer1Q9CQL2 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccer1Q9CQL2 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccer1Q9CQL2 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccer1Q9CQL2 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccer1Q9CQL2 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccer1Q9CQL2 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccer1Q9CQL2 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccer1Q9CQL2 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccer1Q9CQL2 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccer1Q9CQL2 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccer1Q9CQL2 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccer1Q9CQL2 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccer1Q9CQL2 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccer1Q9CQL2 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccer1Q9CQL2 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccer1Q9CQL2 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccer1Q9CQL2 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccer1Q9CQL2 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccer1Q9CQL2 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccer1Q9CQL2 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccer1Q9CQL2 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccer1Q9CQL2 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccer1Q9CQL2 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccer1Q9CQL2 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccer1Q9CQL2 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccer1Q9CQL2 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccer1Q9CQL2 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccer1Q9CQL2 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccer1Q9CQL2 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccer1Q9CQL2 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccer1Q9CQL2 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccer1Q9CQL2 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccer1Q9CQL2 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccer1Q9CQL2 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccer1Q9CQL2 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccer1Q9CQL2 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccer1Q9CQL2 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccer1Q9CQL2 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccer1Q9CQL2 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccer1Q9CQL2 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccer1Q9CQL2 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccer1Q9CQL2 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccer1Q9CQL2 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccer1Q9CQL2 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccer1Q9CQL2 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccer1Q9CQL2 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccer1Q9CQL2 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccer1Q9CQL2 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccer1Q9CQL2 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccer1Q9CQL2 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccer1Q9CQL2 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccer1Q9CQL2 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccer1Q9CQL2 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccer1Q9CQL2 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccer1Q9CQL2 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccer1Q9CQL2 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccer1Q9CQL2 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms