Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ8

Ndufb9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufb9Q9CQJ8 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ndufb9Q9CQJ8 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ndufb9Q9CQJ8 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ndufb9Q9CQJ8 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ndufb9Q9CQJ8 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ndufb9Q9CQJ8 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ndufb9Q9CQJ8 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ndufb9Q9CQJ8 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ndufb9Q9CQJ8 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ndufb9Q9CQJ8 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ndufb9Q9CQJ8 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ndufb9Q9CQJ8 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ndufb9Q9CQJ8 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ndufb9Q9CQJ8 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ndufb9Q9CQJ8 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ndufb9Q9CQJ8 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ndufb9Q9CQJ8 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Ndufb9Q9CQJ8 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ndufb9Q9CQJ8 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ndufb9Q9CQJ8 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ndufb9Q9CQJ8 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ndufb9Q9CQJ8 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ndufb9Q9CQJ8 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ndufb9Q9CQJ8 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ndufb9Q9CQJ8 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ndufb9Q9CQJ8 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ndufb9Q9CQJ8 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ndufb9Q9CQJ8 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ndufb9Q9CQJ8 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ndufb9Q9CQJ8 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ndufb9Q9CQJ8 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ndufb9Q9CQJ8 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ndufb9Q9CQJ8 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ndufb9Q9CQJ8 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ndufb9Q9CQJ8 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ndufb9Q9CQJ8 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ndufb9Q9CQJ8 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ndufb9Q9CQJ8 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ndufb9Q9CQJ8 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ndufb9Q9CQJ8 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ndufb9Q9CQJ8 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ndufb9Q9CQJ8 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ndufb9Q9CQJ8 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ndufb9Q9CQJ8 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ndufb9Q9CQJ8 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ndufb9Q9CQJ8 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ndufb9Q9CQJ8 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ndufb9Q9CQJ8 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ndufb9Q9CQJ8 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ndufb9Q9CQJ8 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ndufb9Q9CQJ8 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ndufb9Q9CQJ8 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ndufb9Q9CQJ8 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Ndufb9Q9CQJ8 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ndufb9Q9CQJ8 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ndufb9Q9CQJ8 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ndufb9Q9CQJ8 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ndufb9Q9CQJ8 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ndufb9Q9CQJ8 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ndufb9Q9CQJ8 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ndufb9Q9CQJ8 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ndufb9Q9CQJ8 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ndufb9Q9CQJ8 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ndufb9Q9CQJ8 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ndufb9Q9CQJ8 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ndufb9Q9CQJ8 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ndufb9Q9CQJ8 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ndufb9Q9CQJ8 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ndufb9Q9CQJ8 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ndufb9Q9CQJ8 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ndufb9Q9CQJ8 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ndufb9Q9CQJ8 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ndufb9Q9CQJ8 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ndufb9Q9CQJ8 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ndufb9Q9CQJ8 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ndufb9Q9CQJ8 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ndufb9Q9CQJ8 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ndufb9Q9CQJ8 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Ndufb9Q9CQJ8 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ndufb9Q9CQJ8 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ndufb9Q9CQJ8 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ndufb9Q9CQJ8 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ndufb9Q9CQJ8 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ndufb9Q9CQJ8 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ndufb9Q9CQJ8 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ndufb9Q9CQJ8 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ndufb9Q9CQJ8 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ndufb9Q9CQJ8 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ndufb9Q9CQJ8 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ndufb9Q9CQJ8 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ndufb9Q9CQJ8 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Ndufb9Q9CQJ8 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ndufb9Q9CQJ8 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ndufb9Q9CQJ8 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ndufb9Q9CQJ8 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ndufb9Q9CQJ8 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ndufb9Q9CQJ8 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ndufb9Q9CQJ8 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ndufb9Q9CQJ8 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ndufb9Q9CQJ8 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms