Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF3

Nudt21, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudt21Q9CQF3 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nudt21Q9CQF3 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nudt21Q9CQF3 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nudt21Q9CQF3 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nudt21Q9CQF3 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nudt21Q9CQF3 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Nudt21Q9CQF3 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nudt21Q9CQF3 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nudt21Q9CQF3 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nudt21Q9CQF3 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nudt21Q9CQF3 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nudt21Q9CQF3 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nudt21Q9CQF3 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nudt21Q9CQF3 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nudt21Q9CQF3 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nudt21Q9CQF3 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nudt21Q9CQF3 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nudt21Q9CQF3 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Nudt21Q9CQF3 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nudt21Q9CQF3 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nudt21Q9CQF3 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nudt21Q9CQF3 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nudt21Q9CQF3 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nudt21Q9CQF3 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nudt21Q9CQF3 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Nudt21Q9CQF3 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Nudt21Q9CQF3 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Nudt21Q9CQF3 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Nudt21Q9CQF3 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nudt21Q9CQF3 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nudt21Q9CQF3 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nudt21Q9CQF3 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nudt21Q9CQF3 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nudt21Q9CQF3 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nudt21Q9CQF3 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nudt21Q9CQF3 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nudt21Q9CQF3 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nudt21Q9CQF3 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nudt21Q9CQF3 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nudt21Q9CQF3 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nudt21Q9CQF3 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nudt21Q9CQF3 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nudt21Q9CQF3 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nudt21Q9CQF3 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nudt21Q9CQF3 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nudt21Q9CQF3 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nudt21Q9CQF3 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nudt21Q9CQF3 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nudt21Q9CQF3 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nudt21Q9CQF3 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nudt21Q9CQF3 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nudt21Q9CQF3 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nudt21Q9CQF3 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nudt21Q9CQF3 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nudt21Q9CQF3 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Nudt21Q9CQF3 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nudt21Q9CQF3 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nudt21Q9CQF3 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nudt21Q9CQF3 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nudt21Q9CQF3 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nudt21Q9CQF3 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nudt21Q9CQF3 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nudt21Q9CQF3 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nudt21Q9CQF3 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nudt21Q9CQF3 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nudt21Q9CQF3 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nudt21Q9CQF3 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nudt21Q9CQF3 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nudt21Q9CQF3 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nudt21Q9CQF3 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nudt21Q9CQF3 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nudt21Q9CQF3 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nudt21Q9CQF3 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nudt21Q9CQF3 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nudt21Q9CQF3 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nudt21Q9CQF3 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nudt21Q9CQF3 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nudt21Q9CQF3 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nudt21Q9CQF3 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nudt21Q9CQF3 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nudt21Q9CQF3 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nudt21Q9CQF3 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nudt21Q9CQF3 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nudt21Q9CQF3 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nudt21Q9CQF3 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nudt21Q9CQF3 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nudt21Q9CQF3 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nudt21Q9CQF3 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nudt21Q9CQF3 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nudt21Q9CQF3 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nudt21Q9CQF3 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nudt21Q9CQF3 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nudt21Q9CQF3 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nudt21Q9CQF3 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nudt21Q9CQF3 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nudt21Q9CQF3 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nudt21Q9CQF3 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nudt21Q9CQF3 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nudt21Q9CQF3 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nudt21Q9CQF3 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms