Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF0

Mrpl11, 39S ribosomal protein L11, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl11Q9CQF0 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mrpl11Q9CQF0 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mrpl11Q9CQF0 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mrpl11Q9CQF0 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mrpl11Q9CQF0 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mrpl11Q9CQF0 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mrpl11Q9CQF0 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mrpl11Q9CQF0 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mrpl11Q9CQF0 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mrpl11Q9CQF0 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mrpl11Q9CQF0 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Mrpl11Q9CQF0 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mrpl11Q9CQF0 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mrpl11Q9CQF0 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mrpl11Q9CQF0 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mrpl11Q9CQF0 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mrpl11Q9CQF0 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mrpl11Q9CQF0 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mrpl11Q9CQF0 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mrpl11Q9CQF0 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mrpl11Q9CQF0 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mrpl11Q9CQF0 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mrpl11Q9CQF0 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mrpl11Q9CQF0 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mrpl11Q9CQF0 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mrpl11Q9CQF0 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mrpl11Q9CQF0 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mrpl11Q9CQF0 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mrpl11Q9CQF0 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mrpl11Q9CQF0 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mrpl11Q9CQF0 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mrpl11Q9CQF0 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mrpl11Q9CQF0 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mrpl11Q9CQF0 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mrpl11Q9CQF0 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mrpl11Q9CQF0 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mrpl11Q9CQF0 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mrpl11Q9CQF0 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mrpl11Q9CQF0 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mrpl11Q9CQF0 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mrpl11Q9CQF0 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Mrpl11Q9CQF0 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mrpl11Q9CQF0 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mrpl11Q9CQF0 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mrpl11Q9CQF0 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mrpl11Q9CQF0 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mrpl11Q9CQF0 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mrpl11Q9CQF0 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mrpl11Q9CQF0 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mrpl11Q9CQF0 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mrpl11Q9CQF0 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mrpl11Q9CQF0 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mrpl11Q9CQF0 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mrpl11Q9CQF0 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Mrpl11Q9CQF0 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mrpl11Q9CQF0 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mrpl11Q9CQF0 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mrpl11Q9CQF0 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mrpl11Q9CQF0 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Mrpl11Q9CQF0 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mrpl11Q9CQF0 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mrpl11Q9CQF0 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mrpl11Q9CQF0 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mrpl11Q9CQF0 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mrpl11Q9CQF0 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mrpl11Q9CQF0 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mrpl11Q9CQF0 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mrpl11Q9CQF0 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mrpl11Q9CQF0 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mrpl11Q9CQF0 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mrpl11Q9CQF0 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mrpl11Q9CQF0 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mrpl11Q9CQF0 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mrpl11Q9CQF0 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mrpl11Q9CQF0 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mrpl11Q9CQF0 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mrpl11Q9CQF0 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mrpl11Q9CQF0 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mrpl11Q9CQF0 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mrpl11Q9CQF0 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mrpl11Q9CQF0 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Mrpl11Q9CQF0 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mrpl11Q9CQF0 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mrpl11Q9CQF0 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Mrpl11Q9CQF0 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mrpl11Q9CQF0 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mrpl11Q9CQF0 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mrpl11Q9CQF0 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mrpl11Q9CQF0 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mrpl11Q9CQF0 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mrpl11Q9CQF0 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mrpl11Q9CQF0 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mrpl11Q9CQF0 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mrpl11Q9CQF0 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mrpl11Q9CQF0 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mrpl11Q9CQF0 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mrpl11Q9CQF0 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Mrpl11Q9CQF0 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Mrpl11Q9CQF0 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mrpl11Q9CQF0 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 323.1 ms