Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE1

Nipsnap3b, Protein NipSnap homolog 3B, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap3bQ9CQE1 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nipsnap3bQ9CQE1 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nipsnap3bQ9CQE1 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nipsnap3bQ9CQE1 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Nipsnap3bQ9CQE1 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Nipsnap3bQ9CQE1 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nipsnap3bQ9CQE1 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nipsnap3bQ9CQE1 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nipsnap3bQ9CQE1 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nipsnap3bQ9CQE1 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nipsnap3bQ9CQE1 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nipsnap3bQ9CQE1 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nipsnap3bQ9CQE1 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nipsnap3bQ9CQE1 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nipsnap3bQ9CQE1 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nipsnap3bQ9CQE1 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nipsnap3bQ9CQE1 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nipsnap3bQ9CQE1 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nipsnap3bQ9CQE1 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nipsnap3bQ9CQE1 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nipsnap3bQ9CQE1 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nipsnap3bQ9CQE1 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nipsnap3bQ9CQE1 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nipsnap3bQ9CQE1 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nipsnap3bQ9CQE1 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nipsnap3bQ9CQE1 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nipsnap3bQ9CQE1 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nipsnap3bQ9CQE1 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nipsnap3bQ9CQE1 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nipsnap3bQ9CQE1 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nipsnap3bQ9CQE1 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Nipsnap3bQ9CQE1 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nipsnap3bQ9CQE1 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nipsnap3bQ9CQE1 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nipsnap3bQ9CQE1 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nipsnap3bQ9CQE1 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nipsnap3bQ9CQE1 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nipsnap3bQ9CQE1 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nipsnap3bQ9CQE1 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nipsnap3bQ9CQE1 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nipsnap3bQ9CQE1 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nipsnap3bQ9CQE1 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nipsnap3bQ9CQE1 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nipsnap3bQ9CQE1 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nipsnap3bQ9CQE1 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nipsnap3bQ9CQE1 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nipsnap3bQ9CQE1 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nipsnap3bQ9CQE1 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nipsnap3bQ9CQE1 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nipsnap3bQ9CQE1 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nipsnap3bQ9CQE1 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nipsnap3bQ9CQE1 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nipsnap3bQ9CQE1 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nipsnap3bQ9CQE1 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nipsnap3bQ9CQE1 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Nipsnap3bQ9CQE1 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nipsnap3bQ9CQE1 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nipsnap3bQ9CQE1 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nipsnap3bQ9CQE1 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nipsnap3bQ9CQE1 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nipsnap3bQ9CQE1 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nipsnap3bQ9CQE1 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nipsnap3bQ9CQE1 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nipsnap3bQ9CQE1 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nipsnap3bQ9CQE1 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nipsnap3bQ9CQE1 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nipsnap3bQ9CQE1 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nipsnap3bQ9CQE1 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nipsnap3bQ9CQE1 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nipsnap3bQ9CQE1 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nipsnap3bQ9CQE1 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Nipsnap3bQ9CQE1 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nipsnap3bQ9CQE1 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Nipsnap3bQ9CQE1 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Nipsnap3bQ9CQE1 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nipsnap3bQ9CQE1 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nipsnap3bQ9CQE1 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nipsnap3bQ9CQE1 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nipsnap3bQ9CQE1 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nipsnap3bQ9CQE1 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nipsnap3bQ9CQE1 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nipsnap3bQ9CQE1 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nipsnap3bQ9CQE1 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nipsnap3bQ9CQE1 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nipsnap3bQ9CQE1 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nipsnap3bQ9CQE1 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nipsnap3bQ9CQE1 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nipsnap3bQ9CQE1 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nipsnap3bQ9CQE1 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nipsnap3bQ9CQE1 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms