Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ79

Txndc9, Thioredoxin domain-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Txndc9Q9CQ79 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Txndc9Q9CQ79 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Txndc9Q9CQ79 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Txndc9Q9CQ79 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Txndc9Q9CQ79 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Txndc9Q9CQ79 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Txndc9Q9CQ79 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Txndc9Q9CQ79 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Txndc9Q9CQ79 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Txndc9Q9CQ79 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Txndc9Q9CQ79 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Txndc9Q9CQ79 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Txndc9Q9CQ79 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Txndc9Q9CQ79 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Txndc9Q9CQ79 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Txndc9Q9CQ79 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Txndc9Q9CQ79 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Txndc9Q9CQ79 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Txndc9Q9CQ79 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Txndc9Q9CQ79 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Txndc9Q9CQ79 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Txndc9Q9CQ79 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Txndc9Q9CQ79 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Txndc9Q9CQ79 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Txndc9Q9CQ79 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Txndc9Q9CQ79 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Txndc9Q9CQ79 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Txndc9Q9CQ79 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Txndc9Q9CQ79 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Txndc9Q9CQ79 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Txndc9Q9CQ79 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Txndc9Q9CQ79 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Txndc9Q9CQ79 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Txndc9Q9CQ79 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Txndc9Q9CQ79 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Txndc9Q9CQ79 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Txndc9Q9CQ79 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Txndc9Q9CQ79 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Txndc9Q9CQ79 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Txndc9Q9CQ79 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Txndc9Q9CQ79 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Txndc9Q9CQ79 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Txndc9Q9CQ79 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Txndc9Q9CQ79 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Txndc9Q9CQ79 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Txndc9Q9CQ79 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Txndc9Q9CQ79 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Txndc9Q9CQ79 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Txndc9Q9CQ79 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Txndc9Q9CQ79 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Txndc9Q9CQ79 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Txndc9Q9CQ79 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Txndc9Q9CQ79 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Txndc9Q9CQ79 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Txndc9Q9CQ79 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Txndc9Q9CQ79 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Txndc9Q9CQ79 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Txndc9Q9CQ79 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Txndc9Q9CQ79 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Txndc9Q9CQ79 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Txndc9Q9CQ79 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Txndc9Q9CQ79 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Txndc9Q9CQ79 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Txndc9Q9CQ79 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Txndc9Q9CQ79 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Txndc9Q9CQ79 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Txndc9Q9CQ79 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Txndc9Q9CQ79 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Txndc9Q9CQ79 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Txndc9Q9CQ79 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Txndc9Q9CQ79 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Txndc9Q9CQ79 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Txndc9Q9CQ79 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Txndc9Q9CQ79 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Txndc9Q9CQ79 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Txndc9Q9CQ79 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Txndc9Q9CQ79 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Txndc9Q9CQ79 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Txndc9Q9CQ79 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Txndc9Q9CQ79 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Txndc9Q9CQ79 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Txndc9Q9CQ79 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Txndc9Q9CQ79 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Txndc9Q9CQ79 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Txndc9Q9CQ79 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Txndc9Q9CQ79 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Txndc9Q9CQ79 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Txndc9Q9CQ79 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Txndc9Q9CQ79 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Txndc9Q9CQ79 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Txndc9Q9CQ79 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Txndc9Q9CQ79 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Txndc9Q9CQ79 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Txndc9Q9CQ79 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Txndc9Q9CQ79 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Txndc9Q9CQ79 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Txndc9Q9CQ79 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Txndc9Q9CQ79 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Txndc9Q9CQ79 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Txndc9Q9CQ79 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms