Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ68

1700029P11Rik, RIKEN cDNA 1700029P11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700029P11RikQ9CQ68 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
1700029P11RikQ9CQ68 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
1700029P11RikQ9CQ68 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
1700029P11RikQ9CQ68 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
1700029P11RikQ9CQ68 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
1700029P11RikQ9CQ68 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
1700029P11RikQ9CQ68 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
1700029P11RikQ9CQ68 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
1700029P11RikQ9CQ68 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
1700029P11RikQ9CQ68 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
1700029P11RikQ9CQ68 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
1700029P11RikQ9CQ68 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
1700029P11RikQ9CQ68 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
1700029P11RikQ9CQ68 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
1700029P11RikQ9CQ68 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
1700029P11RikQ9CQ68 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
1700029P11RikQ9CQ68 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
1700029P11RikQ9CQ68 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
1700029P11RikQ9CQ68 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
1700029P11RikQ9CQ68 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
1700029P11RikQ9CQ68 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
1700029P11RikQ9CQ68 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
1700029P11RikQ9CQ68 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
1700029P11RikQ9CQ68 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
1700029P11RikQ9CQ68 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
1700029P11RikQ9CQ68 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
1700029P11RikQ9CQ68 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
1700029P11RikQ9CQ68 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
1700029P11RikQ9CQ68 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
1700029P11RikQ9CQ68 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
1700029P11RikQ9CQ68 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
1700029P11RikQ9CQ68 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
1700029P11RikQ9CQ68 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
1700029P11RikQ9CQ68 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
1700029P11RikQ9CQ68 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
1700029P11RikQ9CQ68 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
1700029P11RikQ9CQ68 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
1700029P11RikQ9CQ68 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
1700029P11RikQ9CQ68 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
1700029P11RikQ9CQ68 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
1700029P11RikQ9CQ68 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
1700029P11RikQ9CQ68 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
1700029P11RikQ9CQ68 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
1700029P11RikQ9CQ68 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
1700029P11RikQ9CQ68 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
1700029P11RikQ9CQ68 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
1700029P11RikQ9CQ68 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
1700029P11RikQ9CQ68 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
1700029P11RikQ9CQ68 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
1700029P11RikQ9CQ68 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
1700029P11RikQ9CQ68 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
1700029P11RikQ9CQ68 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
1700029P11RikQ9CQ68 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
1700029P11RikQ9CQ68 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
1700029P11RikQ9CQ68 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
1700029P11RikQ9CQ68 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
1700029P11RikQ9CQ68 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
1700029P11RikQ9CQ68 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
1700029P11RikQ9CQ68 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
1700029P11RikQ9CQ68 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
1700029P11RikQ9CQ68 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
1700029P11RikQ9CQ68 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
1700029P11RikQ9CQ68 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
1700029P11RikQ9CQ68 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
1700029P11RikQ9CQ68 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
1700029P11RikQ9CQ68 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
1700029P11RikQ9CQ68 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
1700029P11RikQ9CQ68 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
1700029P11RikQ9CQ68 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
1700029P11RikQ9CQ68 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
1700029P11RikQ9CQ68 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
1700029P11RikQ9CQ68 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
1700029P11RikQ9CQ68 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
1700029P11RikQ9CQ68 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
1700029P11RikQ9CQ68 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
1700029P11RikQ9CQ68 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
1700029P11RikQ9CQ68 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
1700029P11RikQ9CQ68 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
1700029P11RikQ9CQ68 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
1700029P11RikQ9CQ68 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
1700029P11RikQ9CQ68 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
1700029P11RikQ9CQ68 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
1700029P11RikQ9CQ68 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
1700029P11RikQ9CQ68 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
1700029P11RikQ9CQ68 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
1700029P11RikQ9CQ68 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
1700029P11RikQ9CQ68 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
1700029P11RikQ9CQ68 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
1700029P11RikQ9CQ68 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
1700029P11RikQ9CQ68 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
1700029P11RikQ9CQ68 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
1700029P11RikQ9CQ68 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
1700029P11RikQ9CQ68 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
1700029P11RikQ9CQ68 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
1700029P11RikQ9CQ68 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
1700029P11RikQ9CQ68 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
1700029P11RikQ9CQ68 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
1700029P11RikQ9CQ68 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
1700029P11RikQ9CQ68 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
1700029P11RikQ9CQ68 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms