Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Chmp3Q9CQ10 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Chmp3Q9CQ10 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Chmp3Q9CQ10 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Chmp3Q9CQ10 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Chmp3Q9CQ10 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Chmp3Q9CQ10 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Chmp3Q9CQ10 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Chmp3Q9CQ10 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Chmp3Q9CQ10 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Chmp3Q9CQ10 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Chmp3Q9CQ10 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Chmp3Q9CQ10 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Chmp3Q9CQ10 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Chmp3Q9CQ10 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Chmp3Q9CQ10 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Chmp3Q9CQ10 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Chmp3Q9CQ10 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Chmp3Q9CQ10 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Chmp3Q9CQ10 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Chmp3Q9CQ10 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Chmp3Q9CQ10 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Chmp3Q9CQ10 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Chmp3Q9CQ10 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Chmp3Q9CQ10 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Chmp3Q9CQ10 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Chmp3Q9CQ10 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Chmp3Q9CQ10 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Chmp3Q9CQ10 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Chmp3Q9CQ10 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Chmp3Q9CQ10 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Chmp3Q9CQ10 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Chmp3Q9CQ10 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Chmp3Q9CQ10 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Chmp3Q9CQ10 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Chmp3Q9CQ10 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Chmp3Q9CQ10 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Chmp3Q9CQ10 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Chmp3Q9CQ10 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Chmp3Q9CQ10 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Chmp3Q9CQ10 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Chmp3Q9CQ10 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Chmp3Q9CQ10 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Chmp3Q9CQ10 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Chmp3Q9CQ10 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Chmp3Q9CQ10 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Chmp3Q9CQ10 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Chmp3Q9CQ10 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Chmp3Q9CQ10 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Chmp3Q9CQ10 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Chmp3Q9CQ10 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Chmp3Q9CQ10 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Chmp3Q9CQ10 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Chmp3Q9CQ10 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Chmp3Q9CQ10 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Chmp3Q9CQ10 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Chmp3Q9CQ10 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Chmp3Q9CQ10 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Chmp3Q9CQ10 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Chmp3Q9CQ10 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Chmp3Q9CQ10 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Chmp3Q9CQ10 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Chmp3Q9CQ10 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Chmp3Q9CQ10 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Chmp3Q9CQ10 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Chmp3Q9CQ10 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Chmp3Q9CQ10 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Chmp3Q9CQ10 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Chmp3Q9CQ10 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Chmp3Q9CQ10 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Chmp3Q9CQ10 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Chmp3Q9CQ10 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Chmp3Q9CQ10 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Chmp3Q9CQ10 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Chmp3Q9CQ10 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Chmp3Q9CQ10 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Chmp3Q9CQ10 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Chmp3Q9CQ10 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Chmp3Q9CQ10 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Chmp3Q9CQ10 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Chmp3Q9CQ10 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Chmp3Q9CQ10 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Chmp3Q9CQ10 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Chmp3Q9CQ10 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Chmp3Q9CQ10 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Chmp3Q9CQ10 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Chmp3Q9CQ10 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Chmp3Q9CQ10 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Chmp3Q9CQ10 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Chmp3Q9CQ10 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Chmp3Q9CQ10 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Chmp3Q9CQ10 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Chmp3Q9CQ10 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Chmp3Q9CQ10 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Chmp3Q9CQ10 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Chmp3Q9CQ10 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Chmp3Q9CQ10 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Chmp3Q9CQ10 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Chmp3Q9CQ10 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Chmp3Q9CQ10 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
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