Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ07

Lrrc18, Leucine-rich repeat-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc18Q9CQ07 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrc18Q9CQ07 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrc18Q9CQ07 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrc18Q9CQ07 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrc18Q9CQ07 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrc18Q9CQ07 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrc18Q9CQ07 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrc18Q9CQ07 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrc18Q9CQ07 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrc18Q9CQ07 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrc18Q9CQ07 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrc18Q9CQ07 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrc18Q9CQ07 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrc18Q9CQ07 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrc18Q9CQ07 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrc18Q9CQ07 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrc18Q9CQ07 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrc18Q9CQ07 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrc18Q9CQ07 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrc18Q9CQ07 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrc18Q9CQ07 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrc18Q9CQ07 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrc18Q9CQ07 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrc18Q9CQ07 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrc18Q9CQ07 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrc18Q9CQ07 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrc18Q9CQ07 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrc18Q9CQ07 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrc18Q9CQ07 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrc18Q9CQ07 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrc18Q9CQ07 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrc18Q9CQ07 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrc18Q9CQ07 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrc18Q9CQ07 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrc18Q9CQ07 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrc18Q9CQ07 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrc18Q9CQ07 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrc18Q9CQ07 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrc18Q9CQ07 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrc18Q9CQ07 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrc18Q9CQ07 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrc18Q9CQ07 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrc18Q9CQ07 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrc18Q9CQ07 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrc18Q9CQ07 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrc18Q9CQ07 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrc18Q9CQ07 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrc18Q9CQ07 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrc18Q9CQ07 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrc18Q9CQ07 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrc18Q9CQ07 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrc18Q9CQ07 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrc18Q9CQ07 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrc18Q9CQ07 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrc18Q9CQ07 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrc18Q9CQ07 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrc18Q9CQ07 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrc18Q9CQ07 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrc18Q9CQ07 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrc18Q9CQ07 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrc18Q9CQ07 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrc18Q9CQ07 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrc18Q9CQ07 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc18Q9CQ07 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc18Q9CQ07 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc18Q9CQ07 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc18Q9CQ07 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc18Q9CQ07 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc18Q9CQ07 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc18Q9CQ07 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc18Q9CQ07 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc18Q9CQ07 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc18Q9CQ07 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc18Q9CQ07 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc18Q9CQ07 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc18Q9CQ07 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc18Q9CQ07 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc18Q9CQ07 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc18Q9CQ07 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc18Q9CQ07 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc18Q9CQ07 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc18Q9CQ07 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc18Q9CQ07 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc18Q9CQ07 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc18Q9CQ07 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc18Q9CQ07 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc18Q9CQ07 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc18Q9CQ07 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc18Q9CQ07 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc18Q9CQ07 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc18Q9CQ07 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrc18Q9CQ07 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrc18Q9CQ07 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrc18Q9CQ07 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrc18Q9CQ07 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrc18Q9CQ07 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrc18Q9CQ07 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrc18Q9CQ07 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrc18Q9CQ07 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrc18Q9CQ07 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms