Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR7

Sike1, Suppressor of IKBKE 1, mousemouse

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Length 207 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sike1Q9CPR7 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sike1Q9CPR7 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sike1Q9CPR7 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sike1Q9CPR7 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sike1Q9CPR7 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sike1Q9CPR7 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sike1Q9CPR7 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sike1Q9CPR7 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sike1Q9CPR7 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sike1Q9CPR7 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sike1Q9CPR7 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sike1Q9CPR7 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sike1Q9CPR7 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sike1Q9CPR7 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sike1Q9CPR7 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sike1Q9CPR7 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sike1Q9CPR7 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sike1Q9CPR7 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sike1Q9CPR7 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sike1Q9CPR7 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sike1Q9CPR7 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sike1Q9CPR7 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sike1Q9CPR7 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sike1Q9CPR7 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sike1Q9CPR7 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sike1Q9CPR7 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sike1Q9CPR7 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sike1Q9CPR7 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sike1Q9CPR7 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sike1Q9CPR7 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sike1Q9CPR7 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sike1Q9CPR7 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sike1Q9CPR7 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sike1Q9CPR7 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sike1Q9CPR7 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sike1Q9CPR7 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sike1Q9CPR7 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sike1Q9CPR7 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sike1Q9CPR7 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sike1Q9CPR7 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sike1Q9CPR7 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sike1Q9CPR7 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sike1Q9CPR7 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sike1Q9CPR7 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Sike1Q9CPR7 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sike1Q9CPR7 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sike1Q9CPR7 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sike1Q9CPR7 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sike1Q9CPR7 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sike1Q9CPR7 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sike1Q9CPR7 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sike1Q9CPR7 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sike1Q9CPR7 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sike1Q9CPR7 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sike1Q9CPR7 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sike1Q9CPR7 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sike1Q9CPR7 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sike1Q9CPR7 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sike1Q9CPR7 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sike1Q9CPR7 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sike1Q9CPR7 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Sike1Q9CPR7 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sike1Q9CPR7 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sike1Q9CPR7 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sike1Q9CPR7 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sike1Q9CPR7 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sike1Q9CPR7 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sike1Q9CPR7 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sike1Q9CPR7 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sike1Q9CPR7 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sike1Q9CPR7 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sike1Q9CPR7 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sike1Q9CPR7 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sike1Q9CPR7 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sike1Q9CPR7 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sike1Q9CPR7 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sike1Q9CPR7 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sike1Q9CPR7 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sike1Q9CPR7 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sike1Q9CPR7 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sike1Q9CPR7 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sike1Q9CPR7 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sike1Q9CPR7 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sike1Q9CPR7 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sike1Q9CPR7 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sike1Q9CPR7 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sike1Q9CPR7 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sike1Q9CPR7 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sike1Q9CPR7 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sike1Q9CPR7 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sike1Q9CPR7 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sike1Q9CPR7 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sike1Q9CPR7 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sike1Q9CPR7 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sike1Q9CPR7 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sike1Q9CPR7 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sike1Q9CPR7 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sike1Q9CPR7 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Sike1Q9CPR7 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sike1Q9CPR7 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms