Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR6

Krt88, Keratin 88, mousemouse

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Length 171 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt88Q9CPR6 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Krt88Q9CPR6 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Krt88Q9CPR6 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Krt88Q9CPR6 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Krt88Q9CPR6 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Krt88Q9CPR6 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Krt88Q9CPR6 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Krt88Q9CPR6 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Krt88Q9CPR6 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Krt88Q9CPR6 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Krt88Q9CPR6 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Krt88Q9CPR6 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Krt88Q9CPR6 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Krt88Q9CPR6 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Krt88Q9CPR6 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Krt88Q9CPR6 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Krt88Q9CPR6 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Krt88Q9CPR6 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Krt88Q9CPR6 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Krt88Q9CPR6 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Krt88Q9CPR6 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Krt88Q9CPR6 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Krt88Q9CPR6 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Krt88Q9CPR6 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Krt88Q9CPR6 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Krt88Q9CPR6 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Krt88Q9CPR6 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Krt88Q9CPR6 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Krt88Q9CPR6 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Krt88Q9CPR6 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Krt88Q9CPR6 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Krt88Q9CPR6 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Krt88Q9CPR6 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Krt88Q9CPR6 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Krt88Q9CPR6 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Krt88Q9CPR6 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Krt88Q9CPR6 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Krt88Q9CPR6 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Krt88Q9CPR6 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Krt88Q9CPR6 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Krt88Q9CPR6 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Krt88Q9CPR6 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Krt88Q9CPR6 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Krt88Q9CPR6 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Krt88Q9CPR6 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Krt88Q9CPR6 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Krt88Q9CPR6 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Krt88Q9CPR6 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Krt88Q9CPR6 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Krt88Q9CPR6 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Krt88Q9CPR6 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Krt88Q9CPR6 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Krt88Q9CPR6 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Krt88Q9CPR6 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Krt88Q9CPR6 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Krt88Q9CPR6 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Krt88Q9CPR6 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Krt88Q9CPR6 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Krt88Q9CPR6 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Krt88Q9CPR6 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Krt88Q9CPR6 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Krt88Q9CPR6 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Krt88Q9CPR6 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Krt88Q9CPR6 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Krt88Q9CPR6 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Krt88Q9CPR6 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Krt88Q9CPR6 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Krt88Q9CPR6 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Krt88Q9CPR6 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Krt88Q9CPR6 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Krt88Q9CPR6 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Krt88Q9CPR6 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Krt88Q9CPR6 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Krt88Q9CPR6 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Krt88Q9CPR6 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Krt88Q9CPR6 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Krt88Q9CPR6 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Krt88Q9CPR6 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Krt88Q9CPR6 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Krt88Q9CPR6 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Krt88Q9CPR6 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Krt88Q9CPR6 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Krt88Q9CPR6 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Krt88Q9CPR6 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms