Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR4

Rpl17, 60S ribosomal protein L17, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 184 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl17Q9CPR4 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rpl17Q9CPR4 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rpl17Q9CPR4 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rpl17Q9CPR4 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rpl17Q9CPR4 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rpl17Q9CPR4 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rpl17Q9CPR4 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rpl17Q9CPR4 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rpl17Q9CPR4 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rpl17Q9CPR4 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rpl17Q9CPR4 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Rpl17Q9CPR4 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Rpl17Q9CPR4 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rpl17Q9CPR4 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rpl17Q9CPR4 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rpl17Q9CPR4 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rpl17Q9CPR4 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rpl17Q9CPR4 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rpl17Q9CPR4 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rpl17Q9CPR4 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Rpl17Q9CPR4 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Rpl17Q9CPR4 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rpl17Q9CPR4 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rpl17Q9CPR4 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Rpl17Q9CPR4 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Rpl17Q9CPR4 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rpl17Q9CPR4 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rpl17Q9CPR4 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rpl17Q9CPR4 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rpl17Q9CPR4 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rpl17Q9CPR4 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rpl17Q9CPR4 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rpl17Q9CPR4 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rpl17Q9CPR4 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rpl17Q9CPR4 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rpl17Q9CPR4 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rpl17Q9CPR4 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rpl17Q9CPR4 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Rpl17Q9CPR4 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rpl17Q9CPR4 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rpl17Q9CPR4 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rpl17Q9CPR4 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rpl17Q9CPR4 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rpl17Q9CPR4 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rpl17Q9CPR4 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rpl17Q9CPR4 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rpl17Q9CPR4 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rpl17Q9CPR4 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rpl17Q9CPR4 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rpl17Q9CPR4 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rpl17Q9CPR4 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rpl17Q9CPR4 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rpl17Q9CPR4 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rpl17Q9CPR4 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rpl17Q9CPR4 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Rpl17Q9CPR4 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rpl17Q9CPR4 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Rpl17Q9CPR4 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rpl17Q9CPR4 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rpl17Q9CPR4 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rpl17Q9CPR4 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rpl17Q9CPR4 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rpl17Q9CPR4 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rpl17Q9CPR4 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rpl17Q9CPR4 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rpl17Q9CPR4 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rpl17Q9CPR4 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rpl17Q9CPR4 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rpl17Q9CPR4 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rpl17Q9CPR4 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rpl17Q9CPR4 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Rpl17Q9CPR4 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rpl17Q9CPR4 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rpl17Q9CPR4 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rpl17Q9CPR4 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Rpl17Q9CPR4 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rpl17Q9CPR4 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rpl17Q9CPR4 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rpl17Q9CPR4 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rpl17Q9CPR4 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rpl17Q9CPR4 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rpl17Q9CPR4 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rpl17Q9CPR4 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rpl17Q9CPR4 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rpl17Q9CPR4 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rpl17Q9CPR4 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rpl17Q9CPR4 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rpl17Q9CPR4 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rpl17Q9CPR4 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rpl17Q9CPR4 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rpl17Q9CPR4 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rpl17Q9CPR4 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rpl17Q9CPR4 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rpl17Q9CPR4 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rpl17Q9CPR4 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rpl17Q9CPR4 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rpl17Q9CPR4 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Rpl17Q9CPR4 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rpl17Q9CPR4 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Rpl17Q9CPR4 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms