Protein–RNA interactions for Protein: Q99PS0

Krt23, Keratin, type I cytoskeletal 23, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt23Q99PS0 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Krt23Q99PS0 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Krt23Q99PS0 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Krt23Q99PS0 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Krt23Q99PS0 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Krt23Q99PS0 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Krt23Q99PS0 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Krt23Q99PS0 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Krt23Q99PS0 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Krt23Q99PS0 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Krt23Q99PS0 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Krt23Q99PS0 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Krt23Q99PS0 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Krt23Q99PS0 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Krt23Q99PS0 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Krt23Q99PS0 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Krt23Q99PS0 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Krt23Q99PS0 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Krt23Q99PS0 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Krt23Q99PS0 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Krt23Q99PS0 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Krt23Q99PS0 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Krt23Q99PS0 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Krt23Q99PS0 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Krt23Q99PS0 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Krt23Q99PS0 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Krt23Q99PS0 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Krt23Q99PS0 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Krt23Q99PS0 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Krt23Q99PS0 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Krt23Q99PS0 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Krt23Q99PS0 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Krt23Q99PS0 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Krt23Q99PS0 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Krt23Q99PS0 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Krt23Q99PS0 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Krt23Q99PS0 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Krt23Q99PS0 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Krt23Q99PS0 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Krt23Q99PS0 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Krt23Q99PS0 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Krt23Q99PS0 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Krt23Q99PS0 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Krt23Q99PS0 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Krt23Q99PS0 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Krt23Q99PS0 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Krt23Q99PS0 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Krt23Q99PS0 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Krt23Q99PS0 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Krt23Q99PS0 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Krt23Q99PS0 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Krt23Q99PS0 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Krt23Q99PS0 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Krt23Q99PS0 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Krt23Q99PS0 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Krt23Q99PS0 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Krt23Q99PS0 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Krt23Q99PS0 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Krt23Q99PS0 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Krt23Q99PS0 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Krt23Q99PS0 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Krt23Q99PS0 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Krt23Q99PS0 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Krt23Q99PS0 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Krt23Q99PS0 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Krt23Q99PS0 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Krt23Q99PS0 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Krt23Q99PS0 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Krt23Q99PS0 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Krt23Q99PS0 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Krt23Q99PS0 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Krt23Q99PS0 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Krt23Q99PS0 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Krt23Q99PS0 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Krt23Q99PS0 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Krt23Q99PS0 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Krt23Q99PS0 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Krt23Q99PS0 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Krt23Q99PS0 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Krt23Q99PS0 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Krt23Q99PS0 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Krt23Q99PS0 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Krt23Q99PS0 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Krt23Q99PS0 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Krt23Q99PS0 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Krt23Q99PS0 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Krt23Q99PS0 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Krt23Q99PS0 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Krt23Q99PS0 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Krt23Q99PS0 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Krt23Q99PS0 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Krt23Q99PS0 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Krt23Q99PS0 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Krt23Q99PS0 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Krt23Q99PS0 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Krt23Q99PS0 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Krt23Q99PS0 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Krt23Q99PS0 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Krt23Q99PS0 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Krt23Q99PS0 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms