Protein–RNA interactions for Protein: Q99PL7

Scd3, Acyl-CoA desaturase 3, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scd3Q99PL7 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scd3Q99PL7 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scd3Q99PL7 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scd3Q99PL7 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Scd3Q99PL7 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scd3Q99PL7 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scd3Q99PL7 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scd3Q99PL7 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scd3Q99PL7 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scd3Q99PL7 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Scd3Q99PL7 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scd3Q99PL7 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scd3Q99PL7 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scd3Q99PL7 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Scd3Q99PL7 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scd3Q99PL7 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scd3Q99PL7 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scd3Q99PL7 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scd3Q99PL7 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Scd3Q99PL7 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scd3Q99PL7 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scd3Q99PL7 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scd3Q99PL7 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scd3Q99PL7 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scd3Q99PL7 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scd3Q99PL7 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scd3Q99PL7 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scd3Q99PL7 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scd3Q99PL7 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scd3Q99PL7 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scd3Q99PL7 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scd3Q99PL7 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Scd3Q99PL7 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scd3Q99PL7 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scd3Q99PL7 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scd3Q99PL7 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scd3Q99PL7 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scd3Q99PL7 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scd3Q99PL7 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scd3Q99PL7 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scd3Q99PL7 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scd3Q99PL7 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scd3Q99PL7 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scd3Q99PL7 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scd3Q99PL7 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scd3Q99PL7 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scd3Q99PL7 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scd3Q99PL7 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scd3Q99PL7 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Scd3Q99PL7 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scd3Q99PL7 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scd3Q99PL7 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Scd3Q99PL7 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scd3Q99PL7 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Scd3Q99PL7 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Scd3Q99PL7 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scd3Q99PL7 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scd3Q99PL7 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scd3Q99PL7 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scd3Q99PL7 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scd3Q99PL7 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scd3Q99PL7 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scd3Q99PL7 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scd3Q99PL7 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scd3Q99PL7 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scd3Q99PL7 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scd3Q99PL7 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scd3Q99PL7 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scd3Q99PL7 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Scd3Q99PL7 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scd3Q99PL7 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scd3Q99PL7 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scd3Q99PL7 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scd3Q99PL7 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scd3Q99PL7 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scd3Q99PL7 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scd3Q99PL7 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scd3Q99PL7 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Scd3Q99PL7 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scd3Q99PL7 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Scd3Q99PL7 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scd3Q99PL7 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scd3Q99PL7 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scd3Q99PL7 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Scd3Q99PL7 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scd3Q99PL7 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scd3Q99PL7 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scd3Q99PL7 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scd3Q99PL7 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Scd3Q99PL7 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Scd3Q99PL7 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Scd3Q99PL7 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Scd3Q99PL7 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Scd3Q99PL7 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Scd3Q99PL7 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Scd3Q99PL7 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Scd3Q99PL7 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scd3Q99PL7 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scd3Q99PL7 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scd3Q99PL7 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms