Protein–RNA interactions for Protein: Q99P69

Nuf2, Kinetochore protein Nuf2, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nuf2Q99P69 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nuf2Q99P69 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nuf2Q99P69 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nuf2Q99P69 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Nuf2Q99P69 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nuf2Q99P69 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Nuf2Q99P69 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nuf2Q99P69 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nuf2Q99P69 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nuf2Q99P69 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nuf2Q99P69 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nuf2Q99P69 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nuf2Q99P69 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nuf2Q99P69 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nuf2Q99P69 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nuf2Q99P69 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nuf2Q99P69 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nuf2Q99P69 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nuf2Q99P69 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nuf2Q99P69 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nuf2Q99P69 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nuf2Q99P69 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nuf2Q99P69 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nuf2Q99P69 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nuf2Q99P69 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nuf2Q99P69 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nuf2Q99P69 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nuf2Q99P69 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nuf2Q99P69 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nuf2Q99P69 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nuf2Q99P69 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nuf2Q99P69 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nuf2Q99P69 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nuf2Q99P69 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nuf2Q99P69 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nuf2Q99P69 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nuf2Q99P69 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nuf2Q99P69 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nuf2Q99P69 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nuf2Q99P69 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nuf2Q99P69 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nuf2Q99P69 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nuf2Q99P69 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nuf2Q99P69 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nuf2Q99P69 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nuf2Q99P69 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nuf2Q99P69 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nuf2Q99P69 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Nuf2Q99P69 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nuf2Q99P69 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nuf2Q99P69 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nuf2Q99P69 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nuf2Q99P69 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nuf2Q99P69 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nuf2Q99P69 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nuf2Q99P69 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nuf2Q99P69 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nuf2Q99P69 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nuf2Q99P69 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nuf2Q99P69 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nuf2Q99P69 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nuf2Q99P69 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nuf2Q99P69 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nuf2Q99P69 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nuf2Q99P69 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nuf2Q99P69 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nuf2Q99P69 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nuf2Q99P69 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nuf2Q99P69 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nuf2Q99P69 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nuf2Q99P69 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nuf2Q99P69 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nuf2Q99P69 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nuf2Q99P69 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nuf2Q99P69 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nuf2Q99P69 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nuf2Q99P69 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nuf2Q99P69 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Nuf2Q99P69 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nuf2Q99P69 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nuf2Q99P69 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nuf2Q99P69 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nuf2Q99P69 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nuf2Q99P69 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nuf2Q99P69 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nuf2Q99P69 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nuf2Q99P69 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nuf2Q99P69 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nuf2Q99P69 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nuf2Q99P69 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nuf2Q99P69 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nuf2Q99P69 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nuf2Q99P69 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nuf2Q99P69 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Nuf2Q99P69 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nuf2Q99P69 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nuf2Q99P69 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nuf2Q99P69 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Nuf2Q99P69 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Nuf2Q99P69 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms