Protein–RNA interactions for Protein: Q99NE5

Rims1, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rims1Q99NE5 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rims1Q99NE5 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rims1Q99NE5 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rims1Q99NE5 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Rims1Q99NE5 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rims1Q99NE5 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rims1Q99NE5 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rims1Q99NE5 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rims1Q99NE5 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rims1Q99NE5 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rims1Q99NE5 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rims1Q99NE5 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rims1Q99NE5 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rims1Q99NE5 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rims1Q99NE5 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rims1Q99NE5 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rims1Q99NE5 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rims1Q99NE5 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rims1Q99NE5 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rims1Q99NE5 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rims1Q99NE5 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rims1Q99NE5 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rims1Q99NE5 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rims1Q99NE5 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rims1Q99NE5 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Rims1Q99NE5 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rims1Q99NE5 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rims1Q99NE5 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rims1Q99NE5 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rims1Q99NE5 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rims1Q99NE5 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Rims1Q99NE5 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rims1Q99NE5 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rims1Q99NE5 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rims1Q99NE5 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rims1Q99NE5 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rims1Q99NE5 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rims1Q99NE5 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rims1Q99NE5 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rims1Q99NE5 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rims1Q99NE5 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rims1Q99NE5 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rims1Q99NE5 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rims1Q99NE5 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rims1Q99NE5 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rims1Q99NE5 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rims1Q99NE5 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rims1Q99NE5 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rims1Q99NE5 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Rims1Q99NE5 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Rims1Q99NE5 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rims1Q99NE5 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rims1Q99NE5 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rims1Q99NE5 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rims1Q99NE5 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rims1Q99NE5 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rims1Q99NE5 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rims1Q99NE5 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rims1Q99NE5 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rims1Q99NE5 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rims1Q99NE5 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Rims1Q99NE5 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rims1Q99NE5 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rims1Q99NE5 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rims1Q99NE5 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Rims1Q99NE5 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rims1Q99NE5 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Rims1Q99NE5 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rims1Q99NE5 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rims1Q99NE5 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rims1Q99NE5 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rims1Q99NE5 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rims1Q99NE5 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rims1Q99NE5 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rims1Q99NE5 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rims1Q99NE5 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rims1Q99NE5 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rims1Q99NE5 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rims1Q99NE5 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rims1Q99NE5 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Rims1Q99NE5 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Rims1Q99NE5 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rims1Q99NE5 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rims1Q99NE5 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Rims1Q99NE5 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rims1Q99NE5 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rims1Q99NE5 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rims1Q99NE5 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Rims1Q99NE5 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rims1Q99NE5 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rims1Q99NE5 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rims1Q99NE5 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rims1Q99NE5 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rims1Q99NE5 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rims1Q99NE5 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rims1Q99NE5 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rims1Q99NE5 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rims1Q99NE5 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rims1Q99NE5 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rims1Q99NE5 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.4 ms