Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB3

Tcam1, Cell adhesion molecule TCAM-1, mousemouse

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcam1Q99NB3 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Tcam1Q99NB3 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tcam1Q99NB3 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tcam1Q99NB3 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tcam1Q99NB3 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tcam1Q99NB3 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tcam1Q99NB3 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tcam1Q99NB3 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tcam1Q99NB3 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tcam1Q99NB3 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tcam1Q99NB3 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tcam1Q99NB3 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tcam1Q99NB3 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tcam1Q99NB3 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tcam1Q99NB3 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tcam1Q99NB3 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tcam1Q99NB3 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tcam1Q99NB3 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tcam1Q99NB3 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tcam1Q99NB3 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tcam1Q99NB3 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tcam1Q99NB3 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tcam1Q99NB3 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tcam1Q99NB3 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tcam1Q99NB3 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tcam1Q99NB3 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tcam1Q99NB3 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tcam1Q99NB3 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tcam1Q99NB3 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tcam1Q99NB3 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tcam1Q99NB3 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tcam1Q99NB3 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tcam1Q99NB3 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tcam1Q99NB3 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tcam1Q99NB3 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tcam1Q99NB3 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tcam1Q99NB3 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tcam1Q99NB3 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tcam1Q99NB3 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tcam1Q99NB3 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tcam1Q99NB3 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tcam1Q99NB3 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tcam1Q99NB3 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tcam1Q99NB3 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tcam1Q99NB3 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tcam1Q99NB3 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tcam1Q99NB3 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tcam1Q99NB3 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tcam1Q99NB3 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tcam1Q99NB3 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tcam1Q99NB3 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tcam1Q99NB3 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tcam1Q99NB3 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tcam1Q99NB3 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Tcam1Q99NB3 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Tcam1Q99NB3 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tcam1Q99NB3 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tcam1Q99NB3 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Tcam1Q99NB3 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tcam1Q99NB3 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tcam1Q99NB3 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tcam1Q99NB3 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tcam1Q99NB3 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tcam1Q99NB3 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tcam1Q99NB3 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tcam1Q99NB3 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tcam1Q99NB3 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tcam1Q99NB3 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tcam1Q99NB3 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tcam1Q99NB3 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tcam1Q99NB3 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tcam1Q99NB3 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tcam1Q99NB3 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tcam1Q99NB3 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tcam1Q99NB3 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tcam1Q99NB3 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tcam1Q99NB3 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tcam1Q99NB3 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tcam1Q99NB3 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tcam1Q99NB3 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tcam1Q99NB3 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tcam1Q99NB3 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tcam1Q99NB3 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Tcam1Q99NB3 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tcam1Q99NB3 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tcam1Q99NB3 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tcam1Q99NB3 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tcam1Q99NB3 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tcam1Q99NB3 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Tcam1Q99NB3 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tcam1Q99NB3 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tcam1Q99NB3 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tcam1Q99NB3 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tcam1Q99NB3 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tcam1Q99NB3 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Tcam1Q99NB3 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tcam1Q99NB3 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tcam1Q99NB3 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tcam1Q99NB3 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tcam1Q99NB3 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms