Protein–RNA interactions for Protein: Q99N85

Mrps18a, 28S ribosomal protein S18a, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrps18aQ99N85 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mrps18aQ99N85 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mrps18aQ99N85 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mrps18aQ99N85 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mrps18aQ99N85 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mrps18aQ99N85 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Mrps18aQ99N85 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mrps18aQ99N85 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mrps18aQ99N85 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mrps18aQ99N85 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mrps18aQ99N85 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mrps18aQ99N85 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mrps18aQ99N85 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mrps18aQ99N85 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mrps18aQ99N85 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mrps18aQ99N85 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mrps18aQ99N85 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mrps18aQ99N85 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mrps18aQ99N85 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mrps18aQ99N85 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mrps18aQ99N85 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mrps18aQ99N85 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mrps18aQ99N85 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Mrps18aQ99N85 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mrps18aQ99N85 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mrps18aQ99N85 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mrps18aQ99N85 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mrps18aQ99N85 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mrps18aQ99N85 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mrps18aQ99N85 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mrps18aQ99N85 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mrps18aQ99N85 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mrps18aQ99N85 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mrps18aQ99N85 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mrps18aQ99N85 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mrps18aQ99N85 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mrps18aQ99N85 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mrps18aQ99N85 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mrps18aQ99N85 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mrps18aQ99N85 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mrps18aQ99N85 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mrps18aQ99N85 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mrps18aQ99N85 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mrps18aQ99N85 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mrps18aQ99N85 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mrps18aQ99N85 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mrps18aQ99N85 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mrps18aQ99N85 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mrps18aQ99N85 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mrps18aQ99N85 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Mrps18aQ99N85 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mrps18aQ99N85 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mrps18aQ99N85 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mrps18aQ99N85 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mrps18aQ99N85 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mrps18aQ99N85 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mrps18aQ99N85 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mrps18aQ99N85 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mrps18aQ99N85 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mrps18aQ99N85 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mrps18aQ99N85 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mrps18aQ99N85 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mrps18aQ99N85 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mrps18aQ99N85 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mrps18aQ99N85 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mrps18aQ99N85 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mrps18aQ99N85 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mrps18aQ99N85 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Mrps18aQ99N85 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mrps18aQ99N85 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mrps18aQ99N85 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mrps18aQ99N85 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mrps18aQ99N85 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mrps18aQ99N85 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mrps18aQ99N85 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mrps18aQ99N85 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mrps18aQ99N85 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mrps18aQ99N85 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mrps18aQ99N85 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mrps18aQ99N85 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mrps18aQ99N85 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mrps18aQ99N85 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mrps18aQ99N85 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mrps18aQ99N85 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Mrps18aQ99N85 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mrps18aQ99N85 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mrps18aQ99N85 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mrps18aQ99N85 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mrps18aQ99N85 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mrps18aQ99N85 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mrps18aQ99N85 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mrps18aQ99N85 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Mrps18aQ99N85 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mrps18aQ99N85 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mrps18aQ99N85 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mrps18aQ99N85 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mrps18aQ99N85 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mrps18aQ99N85 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mrps18aQ99N85 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mrps18aQ99N85 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms