Protein–RNA interactions for Protein: Q99N20

Brms1, Breast cancer metastasis-suppressor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brms1Q99N20 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Brms1Q99N20 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Brms1Q99N20 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Brms1Q99N20 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Brms1Q99N20 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Brms1Q99N20 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Brms1Q99N20 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Brms1Q99N20 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Brms1Q99N20 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Brms1Q99N20 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Brms1Q99N20 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Brms1Q99N20 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Brms1Q99N20 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Brms1Q99N20 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Brms1Q99N20 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Brms1Q99N20 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Brms1Q99N20 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Brms1Q99N20 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Brms1Q99N20 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Brms1Q99N20 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Brms1Q99N20 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Brms1Q99N20 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Brms1Q99N20 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Brms1Q99N20 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Brms1Q99N20 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Brms1Q99N20 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Brms1Q99N20 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Brms1Q99N20 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Brms1Q99N20 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Brms1Q99N20 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Brms1Q99N20 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Brms1Q99N20 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Brms1Q99N20 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Brms1Q99N20 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Brms1Q99N20 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Brms1Q99N20 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Brms1Q99N20 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Brms1Q99N20 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Brms1Q99N20 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Brms1Q99N20 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Brms1Q99N20 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Brms1Q99N20 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Brms1Q99N20 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Brms1Q99N20 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Brms1Q99N20 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Brms1Q99N20 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Brms1Q99N20 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Brms1Q99N20 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Brms1Q99N20 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Brms1Q99N20 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Brms1Q99N20 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Brms1Q99N20 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Brms1Q99N20 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Brms1Q99N20 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Brms1Q99N20 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Brms1Q99N20 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Brms1Q99N20 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Brms1Q99N20 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Brms1Q99N20 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Brms1Q99N20 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Brms1Q99N20 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Brms1Q99N20 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Brms1Q99N20 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Brms1Q99N20 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Brms1Q99N20 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Brms1Q99N20 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Brms1Q99N20 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Brms1Q99N20 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Brms1Q99N20 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Brms1Q99N20 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Brms1Q99N20 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Brms1Q99N20 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Brms1Q99N20 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Brms1Q99N20 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Brms1Q99N20 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Brms1Q99N20 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Brms1Q99N20 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Brms1Q99N20 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Brms1Q99N20 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Brms1Q99N20 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Brms1Q99N20 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Brms1Q99N20 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Brms1Q99N20 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Brms1Q99N20 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Brms1Q99N20 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Brms1Q99N20 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Brms1Q99N20 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Brms1Q99N20 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Brms1Q99N20 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Brms1Q99N20 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Brms1Q99N20 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Brms1Q99N20 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Brms1Q99N20 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Brms1Q99N20 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Brms1Q99N20 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Brms1Q99N20 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Brms1Q99N20 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Brms1Q99N20 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Brms1Q99N20 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Brms1Q99N20 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms