Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR6

Srrt, Serrate RNA effector molecule homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrtQ99MR6 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SrrtQ99MR6 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SrrtQ99MR6 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SrrtQ99MR6 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SrrtQ99MR6 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SrrtQ99MR6 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SrrtQ99MR6 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SrrtQ99MR6 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SrrtQ99MR6 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SrrtQ99MR6 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SrrtQ99MR6 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SrrtQ99MR6 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SrrtQ99MR6 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SrrtQ99MR6 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SrrtQ99MR6 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SrrtQ99MR6 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SrrtQ99MR6 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SrrtQ99MR6 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SrrtQ99MR6 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SrrtQ99MR6 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SrrtQ99MR6 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SrrtQ99MR6 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SrrtQ99MR6 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SrrtQ99MR6 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SrrtQ99MR6 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SrrtQ99MR6 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SrrtQ99MR6 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SrrtQ99MR6 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SrrtQ99MR6 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SrrtQ99MR6 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SrrtQ99MR6 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SrrtQ99MR6 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SrrtQ99MR6 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SrrtQ99MR6 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SrrtQ99MR6 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SrrtQ99MR6 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SrrtQ99MR6 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SrrtQ99MR6 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SrrtQ99MR6 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SrrtQ99MR6 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SrrtQ99MR6 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SrrtQ99MR6 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SrrtQ99MR6 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SrrtQ99MR6 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SrrtQ99MR6 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SrrtQ99MR6 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SrrtQ99MR6 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SrrtQ99MR6 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SrrtQ99MR6 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SrrtQ99MR6 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SrrtQ99MR6 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SrrtQ99MR6 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SrrtQ99MR6 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SrrtQ99MR6 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SrrtQ99MR6 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SrrtQ99MR6 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SrrtQ99MR6 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SrrtQ99MR6 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SrrtQ99MR6 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SrrtQ99MR6 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SrrtQ99MR6 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SrrtQ99MR6 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SrrtQ99MR6 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SrrtQ99MR6 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SrrtQ99MR6 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SrrtQ99MR6 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SrrtQ99MR6 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SrrtQ99MR6 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SrrtQ99MR6 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SrrtQ99MR6 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SrrtQ99MR6 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SrrtQ99MR6 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SrrtQ99MR6 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SrrtQ99MR6 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SrrtQ99MR6 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SrrtQ99MR6 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SrrtQ99MR6 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SrrtQ99MR6 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SrrtQ99MR6 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SrrtQ99MR6 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SrrtQ99MR6 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SrrtQ99MR6 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SrrtQ99MR6 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SrrtQ99MR6 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SrrtQ99MR6 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SrrtQ99MR6 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SrrtQ99MR6 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SrrtQ99MR6 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SrrtQ99MR6 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SrrtQ99MR6 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SrrtQ99MR6 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SrrtQ99MR6 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SrrtQ99MR6 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SrrtQ99MR6 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SrrtQ99MR6 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SrrtQ99MR6 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SrrtQ99MR6 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SrrtQ99MR6 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SrrtQ99MR6 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SrrtQ99MR6 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms