Protein–RNA interactions for Protein: Q99MH6

Nkd1, Protein naked cuticle homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkd1Q99MH6 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nkd1Q99MH6 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nkd1Q99MH6 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Nkd1Q99MH6 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nkd1Q99MH6 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nkd1Q99MH6 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nkd1Q99MH6 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nkd1Q99MH6 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nkd1Q99MH6 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nkd1Q99MH6 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nkd1Q99MH6 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Nkd1Q99MH6 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nkd1Q99MH6 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nkd1Q99MH6 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nkd1Q99MH6 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nkd1Q99MH6 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nkd1Q99MH6 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nkd1Q99MH6 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nkd1Q99MH6 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nkd1Q99MH6 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nkd1Q99MH6 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nkd1Q99MH6 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nkd1Q99MH6 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nkd1Q99MH6 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nkd1Q99MH6 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nkd1Q99MH6 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nkd1Q99MH6 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nkd1Q99MH6 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nkd1Q99MH6 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nkd1Q99MH6 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nkd1Q99MH6 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nkd1Q99MH6 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Nkd1Q99MH6 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nkd1Q99MH6 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nkd1Q99MH6 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nkd1Q99MH6 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nkd1Q99MH6 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Nkd1Q99MH6 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nkd1Q99MH6 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nkd1Q99MH6 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nkd1Q99MH6 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nkd1Q99MH6 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nkd1Q99MH6 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nkd1Q99MH6 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nkd1Q99MH6 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nkd1Q99MH6 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nkd1Q99MH6 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nkd1Q99MH6 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nkd1Q99MH6 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nkd1Q99MH6 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nkd1Q99MH6 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nkd1Q99MH6 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nkd1Q99MH6 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nkd1Q99MH6 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nkd1Q99MH6 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nkd1Q99MH6 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nkd1Q99MH6 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nkd1Q99MH6 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nkd1Q99MH6 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nkd1Q99MH6 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nkd1Q99MH6 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nkd1Q99MH6 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nkd1Q99MH6 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nkd1Q99MH6 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nkd1Q99MH6 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nkd1Q99MH6 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nkd1Q99MH6 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nkd1Q99MH6 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Nkd1Q99MH6 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Nkd1Q99MH6 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nkd1Q99MH6 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nkd1Q99MH6 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nkd1Q99MH6 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nkd1Q99MH6 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nkd1Q99MH6 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nkd1Q99MH6 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nkd1Q99MH6 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Nkd1Q99MH6 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nkd1Q99MH6 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nkd1Q99MH6 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nkd1Q99MH6 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nkd1Q99MH6 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nkd1Q99MH6 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nkd1Q99MH6 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nkd1Q99MH6 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nkd1Q99MH6 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nkd1Q99MH6 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nkd1Q99MH6 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nkd1Q99MH6 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nkd1Q99MH6 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nkd1Q99MH6 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nkd1Q99MH6 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Nkd1Q99MH6 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nkd1Q99MH6 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nkd1Q99MH6 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nkd1Q99MH6 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nkd1Q99MH6 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nkd1Q99MH6 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nkd1Q99MH6 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nkd1Q99MH6 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms