Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ0

Cttnbp2nl, CTTNBP2 N-terminal-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cttnbp2nlQ99LJ0 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cttnbp2nlQ99LJ0 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cttnbp2nlQ99LJ0 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cttnbp2nlQ99LJ0 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cttnbp2nlQ99LJ0 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cttnbp2nlQ99LJ0 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cttnbp2nlQ99LJ0 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cttnbp2nlQ99LJ0 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cttnbp2nlQ99LJ0 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cttnbp2nlQ99LJ0 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cttnbp2nlQ99LJ0 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cttnbp2nlQ99LJ0 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cttnbp2nlQ99LJ0 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cttnbp2nlQ99LJ0 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cttnbp2nlQ99LJ0 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cttnbp2nlQ99LJ0 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cttnbp2nlQ99LJ0 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cttnbp2nlQ99LJ0 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cttnbp2nlQ99LJ0 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cttnbp2nlQ99LJ0 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cttnbp2nlQ99LJ0 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cttnbp2nlQ99LJ0 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cttnbp2nlQ99LJ0 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cttnbp2nlQ99LJ0 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cttnbp2nlQ99LJ0 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cttnbp2nlQ99LJ0 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cttnbp2nlQ99LJ0 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cttnbp2nlQ99LJ0 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cttnbp2nlQ99LJ0 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cttnbp2nlQ99LJ0 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Cttnbp2nlQ99LJ0 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Cttnbp2nlQ99LJ0 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cttnbp2nlQ99LJ0 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cttnbp2nlQ99LJ0 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cttnbp2nlQ99LJ0 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cttnbp2nlQ99LJ0 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cttnbp2nlQ99LJ0 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cttnbp2nlQ99LJ0 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cttnbp2nlQ99LJ0 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cttnbp2nlQ99LJ0 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cttnbp2nlQ99LJ0 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cttnbp2nlQ99LJ0 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cttnbp2nlQ99LJ0 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cttnbp2nlQ99LJ0 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cttnbp2nlQ99LJ0 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cttnbp2nlQ99LJ0 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cttnbp2nlQ99LJ0 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cttnbp2nlQ99LJ0 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cttnbp2nlQ99LJ0 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cttnbp2nlQ99LJ0 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cttnbp2nlQ99LJ0 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cttnbp2nlQ99LJ0 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cttnbp2nlQ99LJ0 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Cttnbp2nlQ99LJ0 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cttnbp2nlQ99LJ0 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cttnbp2nlQ99LJ0 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cttnbp2nlQ99LJ0 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cttnbp2nlQ99LJ0 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cttnbp2nlQ99LJ0 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cttnbp2nlQ99LJ0 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cttnbp2nlQ99LJ0 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cttnbp2nlQ99LJ0 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cttnbp2nlQ99LJ0 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cttnbp2nlQ99LJ0 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cttnbp2nlQ99LJ0 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cttnbp2nlQ99LJ0 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cttnbp2nlQ99LJ0 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cttnbp2nlQ99LJ0 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cttnbp2nlQ99LJ0 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cttnbp2nlQ99LJ0 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cttnbp2nlQ99LJ0 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cttnbp2nlQ99LJ0 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cttnbp2nlQ99LJ0 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cttnbp2nlQ99LJ0 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cttnbp2nlQ99LJ0 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cttnbp2nlQ99LJ0 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cttnbp2nlQ99LJ0 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cttnbp2nlQ99LJ0 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cttnbp2nlQ99LJ0 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Cttnbp2nlQ99LJ0 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cttnbp2nlQ99LJ0 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cttnbp2nlQ99LJ0 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.4 ms