Protein–RNA interactions for Protein: Q99LH9

Sh3bp5l, SH3 domain-binding protein 5-like, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp5lQ99LH9 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sh3bp5lQ99LH9 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sh3bp5lQ99LH9 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sh3bp5lQ99LH9 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sh3bp5lQ99LH9 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sh3bp5lQ99LH9 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sh3bp5lQ99LH9 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sh3bp5lQ99LH9 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sh3bp5lQ99LH9 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sh3bp5lQ99LH9 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sh3bp5lQ99LH9 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sh3bp5lQ99LH9 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sh3bp5lQ99LH9 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sh3bp5lQ99LH9 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sh3bp5lQ99LH9 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sh3bp5lQ99LH9 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sh3bp5lQ99LH9 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sh3bp5lQ99LH9 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sh3bp5lQ99LH9 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sh3bp5lQ99LH9 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sh3bp5lQ99LH9 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sh3bp5lQ99LH9 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sh3bp5lQ99LH9 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sh3bp5lQ99LH9 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sh3bp5lQ99LH9 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sh3bp5lQ99LH9 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sh3bp5lQ99LH9 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sh3bp5lQ99LH9 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sh3bp5lQ99LH9 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sh3bp5lQ99LH9 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sh3bp5lQ99LH9 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sh3bp5lQ99LH9 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sh3bp5lQ99LH9 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sh3bp5lQ99LH9 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sh3bp5lQ99LH9 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sh3bp5lQ99LH9 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sh3bp5lQ99LH9 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sh3bp5lQ99LH9 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sh3bp5lQ99LH9 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sh3bp5lQ99LH9 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sh3bp5lQ99LH9 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sh3bp5lQ99LH9 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sh3bp5lQ99LH9 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sh3bp5lQ99LH9 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sh3bp5lQ99LH9 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sh3bp5lQ99LH9 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sh3bp5lQ99LH9 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sh3bp5lQ99LH9 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sh3bp5lQ99LH9 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sh3bp5lQ99LH9 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sh3bp5lQ99LH9 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sh3bp5lQ99LH9 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sh3bp5lQ99LH9 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sh3bp5lQ99LH9 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sh3bp5lQ99LH9 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Sh3bp5lQ99LH9 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sh3bp5lQ99LH9 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sh3bp5lQ99LH9 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sh3bp5lQ99LH9 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sh3bp5lQ99LH9 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sh3bp5lQ99LH9 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sh3bp5lQ99LH9 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sh3bp5lQ99LH9 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sh3bp5lQ99LH9 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sh3bp5lQ99LH9 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sh3bp5lQ99LH9 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sh3bp5lQ99LH9 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sh3bp5lQ99LH9 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sh3bp5lQ99LH9 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sh3bp5lQ99LH9 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sh3bp5lQ99LH9 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sh3bp5lQ99LH9 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sh3bp5lQ99LH9 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sh3bp5lQ99LH9 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sh3bp5lQ99LH9 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sh3bp5lQ99LH9 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sh3bp5lQ99LH9 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sh3bp5lQ99LH9 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sh3bp5lQ99LH9 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sh3bp5lQ99LH9 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Sh3bp5lQ99LH9 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sh3bp5lQ99LH9 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sh3bp5lQ99LH9 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sh3bp5lQ99LH9 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sh3bp5lQ99LH9 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sh3bp5lQ99LH9 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sh3bp5lQ99LH9 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sh3bp5lQ99LH9 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sh3bp5lQ99LH9 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sh3bp5lQ99LH9 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sh3bp5lQ99LH9 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sh3bp5lQ99LH9 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sh3bp5lQ99LH9 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sh3bp5lQ99LH9 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sh3bp5lQ99LH9 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sh3bp5lQ99LH9 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sh3bp5lQ99LH9 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sh3bp5lQ99LH9 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sh3bp5lQ99LH9 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sh3bp5lQ99LH9 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms