Protein–RNA interactions for Protein: Q99L48

Nmd3, 60S ribosomal export protein NMD3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nmd3Q99L48 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nmd3Q99L48 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nmd3Q99L48 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nmd3Q99L48 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nmd3Q99L48 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nmd3Q99L48 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nmd3Q99L48 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nmd3Q99L48 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nmd3Q99L48 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nmd3Q99L48 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nmd3Q99L48 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nmd3Q99L48 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nmd3Q99L48 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nmd3Q99L48 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nmd3Q99L48 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nmd3Q99L48 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nmd3Q99L48 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nmd3Q99L48 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nmd3Q99L48 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nmd3Q99L48 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nmd3Q99L48 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nmd3Q99L48 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nmd3Q99L48 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nmd3Q99L48 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nmd3Q99L48 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nmd3Q99L48 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nmd3Q99L48 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nmd3Q99L48 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Nmd3Q99L48 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nmd3Q99L48 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nmd3Q99L48 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nmd3Q99L48 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Nmd3Q99L48 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Nmd3Q99L48 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Nmd3Q99L48 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Nmd3Q99L48 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Nmd3Q99L48 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Nmd3Q99L48 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nmd3Q99L48 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Nmd3Q99L48 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Nmd3Q99L48 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nmd3Q99L48 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nmd3Q99L48 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nmd3Q99L48 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nmd3Q99L48 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nmd3Q99L48 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Nmd3Q99L48 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nmd3Q99L48 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nmd3Q99L48 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nmd3Q99L48 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nmd3Q99L48 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nmd3Q99L48 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nmd3Q99L48 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nmd3Q99L48 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nmd3Q99L48 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nmd3Q99L48 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nmd3Q99L48 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nmd3Q99L48 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nmd3Q99L48 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nmd3Q99L48 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nmd3Q99L48 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nmd3Q99L48 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nmd3Q99L48 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nmd3Q99L48 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nmd3Q99L48 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nmd3Q99L48 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nmd3Q99L48 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nmd3Q99L48 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nmd3Q99L48 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nmd3Q99L48 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nmd3Q99L48 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nmd3Q99L48 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nmd3Q99L48 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nmd3Q99L48 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nmd3Q99L48 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nmd3Q99L48 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nmd3Q99L48 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nmd3Q99L48 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nmd3Q99L48 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nmd3Q99L48 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nmd3Q99L48 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nmd3Q99L48 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nmd3Q99L48 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nmd3Q99L48 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nmd3Q99L48 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nmd3Q99L48 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nmd3Q99L48 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nmd3Q99L48 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nmd3Q99L48 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nmd3Q99L48 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nmd3Q99L48 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nmd3Q99L48 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nmd3Q99L48 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nmd3Q99L48 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nmd3Q99L48 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nmd3Q99L48 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nmd3Q99L48 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nmd3Q99L48 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nmd3Q99L48 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nmd3Q99L48 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms