Protein–RNA interactions for Protein: Q99KW3

Triobp, TRIO and F-actin-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 2,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TriobpQ99KW3 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TriobpQ99KW3 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TriobpQ99KW3 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TriobpQ99KW3 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TriobpQ99KW3 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TriobpQ99KW3 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TriobpQ99KW3 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
TriobpQ99KW3 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TriobpQ99KW3 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TriobpQ99KW3 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TriobpQ99KW3 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TriobpQ99KW3 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TriobpQ99KW3 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TriobpQ99KW3 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TriobpQ99KW3 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TriobpQ99KW3 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TriobpQ99KW3 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TriobpQ99KW3 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
TriobpQ99KW3 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
TriobpQ99KW3 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
TriobpQ99KW3 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TriobpQ99KW3 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TriobpQ99KW3 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TriobpQ99KW3 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TriobpQ99KW3 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TriobpQ99KW3 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TriobpQ99KW3 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TriobpQ99KW3 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TriobpQ99KW3 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TriobpQ99KW3 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TriobpQ99KW3 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TriobpQ99KW3 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TriobpQ99KW3 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TriobpQ99KW3 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TriobpQ99KW3 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TriobpQ99KW3 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TriobpQ99KW3 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TriobpQ99KW3 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TriobpQ99KW3 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
TriobpQ99KW3 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TriobpQ99KW3 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TriobpQ99KW3 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TriobpQ99KW3 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TriobpQ99KW3 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TriobpQ99KW3 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TriobpQ99KW3 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TriobpQ99KW3 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TriobpQ99KW3 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
TriobpQ99KW3 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TriobpQ99KW3 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TriobpQ99KW3 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TriobpQ99KW3 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TriobpQ99KW3 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TriobpQ99KW3 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
TriobpQ99KW3 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TriobpQ99KW3 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TriobpQ99KW3 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
TriobpQ99KW3 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TriobpQ99KW3 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TriobpQ99KW3 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TriobpQ99KW3 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TriobpQ99KW3 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TriobpQ99KW3 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TriobpQ99KW3 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TriobpQ99KW3 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TriobpQ99KW3 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TriobpQ99KW3 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TriobpQ99KW3 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TriobpQ99KW3 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TriobpQ99KW3 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TriobpQ99KW3 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TriobpQ99KW3 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TriobpQ99KW3 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TriobpQ99KW3 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TriobpQ99KW3 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TriobpQ99KW3 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TriobpQ99KW3 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TriobpQ99KW3 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TriobpQ99KW3 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TriobpQ99KW3 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TriobpQ99KW3 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TriobpQ99KW3 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TriobpQ99KW3 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TriobpQ99KW3 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
TriobpQ99KW3 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TriobpQ99KW3 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TriobpQ99KW3 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TriobpQ99KW3 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TriobpQ99KW3 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TriobpQ99KW3 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TriobpQ99KW3 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TriobpQ99KW3 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TriobpQ99KW3 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TriobpQ99KW3 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TriobpQ99KW3 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TriobpQ99KW3 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TriobpQ99KW3 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TriobpQ99KW3 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TriobpQ99KW3 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TriobpQ99KW3 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms