Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN9

Clint1, Clathrin interactor 1, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clint1Q99KN9 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clint1Q99KN9 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clint1Q99KN9 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clint1Q99KN9 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clint1Q99KN9 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clint1Q99KN9 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clint1Q99KN9 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clint1Q99KN9 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clint1Q99KN9 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clint1Q99KN9 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clint1Q99KN9 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clint1Q99KN9 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clint1Q99KN9 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clint1Q99KN9 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clint1Q99KN9 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clint1Q99KN9 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Clint1Q99KN9 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clint1Q99KN9 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Clint1Q99KN9 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clint1Q99KN9 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clint1Q99KN9 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clint1Q99KN9 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clint1Q99KN9 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clint1Q99KN9 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clint1Q99KN9 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clint1Q99KN9 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clint1Q99KN9 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clint1Q99KN9 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clint1Q99KN9 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clint1Q99KN9 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clint1Q99KN9 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clint1Q99KN9 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clint1Q99KN9 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clint1Q99KN9 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clint1Q99KN9 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clint1Q99KN9 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clint1Q99KN9 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clint1Q99KN9 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clint1Q99KN9 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clint1Q99KN9 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clint1Q99KN9 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Clint1Q99KN9 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Clint1Q99KN9 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Clint1Q99KN9 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clint1Q99KN9 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clint1Q99KN9 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Clint1Q99KN9 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Clint1Q99KN9 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Clint1Q99KN9 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clint1Q99KN9 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clint1Q99KN9 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clint1Q99KN9 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clint1Q99KN9 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clint1Q99KN9 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clint1Q99KN9 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clint1Q99KN9 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clint1Q99KN9 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Clint1Q99KN9 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Clint1Q99KN9 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Clint1Q99KN9 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Clint1Q99KN9 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Clint1Q99KN9 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clint1Q99KN9 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clint1Q99KN9 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clint1Q99KN9 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clint1Q99KN9 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clint1Q99KN9 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Clint1Q99KN9 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clint1Q99KN9 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clint1Q99KN9 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clint1Q99KN9 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clint1Q99KN9 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clint1Q99KN9 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clint1Q99KN9 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Clint1Q99KN9 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clint1Q99KN9 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clint1Q99KN9 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clint1Q99KN9 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clint1Q99KN9 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clint1Q99KN9 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clint1Q99KN9 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clint1Q99KN9 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clint1Q99KN9 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clint1Q99KN9 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clint1Q99KN9 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clint1Q99KN9 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clint1Q99KN9 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clint1Q99KN9 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clint1Q99KN9 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clint1Q99KN9 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Clint1Q99KN9 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clint1Q99KN9 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clint1Q99KN9 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clint1Q99KN9 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clint1Q99KN9 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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