Protein–RNA interactions for Protein: Q99KG7

Hps4, Hermansky-Pudlak syndrome 4 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps4Q99KG7 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hps4Q99KG7 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hps4Q99KG7 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hps4Q99KG7 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hps4Q99KG7 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hps4Q99KG7 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hps4Q99KG7 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hps4Q99KG7 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hps4Q99KG7 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hps4Q99KG7 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hps4Q99KG7 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hps4Q99KG7 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hps4Q99KG7 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hps4Q99KG7 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hps4Q99KG7 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hps4Q99KG7 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hps4Q99KG7 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hps4Q99KG7 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hps4Q99KG7 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hps4Q99KG7 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hps4Q99KG7 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hps4Q99KG7 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hps4Q99KG7 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hps4Q99KG7 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Hps4Q99KG7 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hps4Q99KG7 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Hps4Q99KG7 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hps4Q99KG7 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hps4Q99KG7 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Hps4Q99KG7 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hps4Q99KG7 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hps4Q99KG7 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hps4Q99KG7 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hps4Q99KG7 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hps4Q99KG7 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hps4Q99KG7 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hps4Q99KG7 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hps4Q99KG7 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hps4Q99KG7 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hps4Q99KG7 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hps4Q99KG7 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hps4Q99KG7 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hps4Q99KG7 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hps4Q99KG7 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hps4Q99KG7 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hps4Q99KG7 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hps4Q99KG7 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hps4Q99KG7 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hps4Q99KG7 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hps4Q99KG7 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hps4Q99KG7 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hps4Q99KG7 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hps4Q99KG7 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hps4Q99KG7 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hps4Q99KG7 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Hps4Q99KG7 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hps4Q99KG7 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hps4Q99KG7 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Hps4Q99KG7 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hps4Q99KG7 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hps4Q99KG7 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hps4Q99KG7 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hps4Q99KG7 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hps4Q99KG7 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hps4Q99KG7 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hps4Q99KG7 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hps4Q99KG7 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hps4Q99KG7 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hps4Q99KG7 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hps4Q99KG7 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hps4Q99KG7 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hps4Q99KG7 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hps4Q99KG7 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hps4Q99KG7 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hps4Q99KG7 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hps4Q99KG7 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hps4Q99KG7 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hps4Q99KG7 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hps4Q99KG7 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hps4Q99KG7 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hps4Q99KG7 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hps4Q99KG7 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hps4Q99KG7 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hps4Q99KG7 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hps4Q99KG7 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hps4Q99KG7 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hps4Q99KG7 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hps4Q99KG7 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hps4Q99KG7 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Hps4Q99KG7 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hps4Q99KG7 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hps4Q99KG7 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hps4Q99KG7 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Hps4Q99KG7 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hps4Q99KG7 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hps4Q99KG7 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hps4Q99KG7 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hps4Q99KG7 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hps4Q99KG7 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hps4Q99KG7 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms