Protein–RNA interactions for Protein: Q99K10

Nlgn1, Neuroligin-1, mousemouse

Predictions only

Length 843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlgn1Q99K10 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nlgn1Q99K10 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nlgn1Q99K10 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nlgn1Q99K10 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nlgn1Q99K10 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nlgn1Q99K10 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nlgn1Q99K10 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nlgn1Q99K10 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Nlgn1Q99K10 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Nlgn1Q99K10 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nlgn1Q99K10 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nlgn1Q99K10 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nlgn1Q99K10 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nlgn1Q99K10 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Nlgn1Q99K10 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nlgn1Q99K10 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nlgn1Q99K10 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nlgn1Q99K10 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nlgn1Q99K10 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nlgn1Q99K10 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nlgn1Q99K10 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nlgn1Q99K10 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nlgn1Q99K10 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nlgn1Q99K10 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nlgn1Q99K10 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nlgn1Q99K10 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nlgn1Q99K10 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nlgn1Q99K10 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Nlgn1Q99K10 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nlgn1Q99K10 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nlgn1Q99K10 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nlgn1Q99K10 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nlgn1Q99K10 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nlgn1Q99K10 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nlgn1Q99K10 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nlgn1Q99K10 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nlgn1Q99K10 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nlgn1Q99K10 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nlgn1Q99K10 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nlgn1Q99K10 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nlgn1Q99K10 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nlgn1Q99K10 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nlgn1Q99K10 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nlgn1Q99K10 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nlgn1Q99K10 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nlgn1Q99K10 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nlgn1Q99K10 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Nlgn1Q99K10 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Nlgn1Q99K10 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Nlgn1Q99K10 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nlgn1Q99K10 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nlgn1Q99K10 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nlgn1Q99K10 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nlgn1Q99K10 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nlgn1Q99K10 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nlgn1Q99K10 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nlgn1Q99K10 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nlgn1Q99K10 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nlgn1Q99K10 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nlgn1Q99K10 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nlgn1Q99K10 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nlgn1Q99K10 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nlgn1Q99K10 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nlgn1Q99K10 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nlgn1Q99K10 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nlgn1Q99K10 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nlgn1Q99K10 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nlgn1Q99K10 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nlgn1Q99K10 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nlgn1Q99K10 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nlgn1Q99K10 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nlgn1Q99K10 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nlgn1Q99K10 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nlgn1Q99K10 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nlgn1Q99K10 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nlgn1Q99K10 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nlgn1Q99K10 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nlgn1Q99K10 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Nlgn1Q99K10 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nlgn1Q99K10 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nlgn1Q99K10 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nlgn1Q99K10 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nlgn1Q99K10 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nlgn1Q99K10 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nlgn1Q99K10 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nlgn1Q99K10 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nlgn1Q99K10 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nlgn1Q99K10 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nlgn1Q99K10 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nlgn1Q99K10 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nlgn1Q99K10 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nlgn1Q99K10 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nlgn1Q99K10 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nlgn1Q99K10 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nlgn1Q99K10 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nlgn1Q99K10 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nlgn1Q99K10 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nlgn1Q99K10 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nlgn1Q99K10 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nlgn1Q99K10 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms