Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY4

Trabd, TraB domain-containing protein, mousemouse

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Length 376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrabdQ99JY4 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TrabdQ99JY4 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TrabdQ99JY4 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TrabdQ99JY4 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TrabdQ99JY4 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
TrabdQ99JY4 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TrabdQ99JY4 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TrabdQ99JY4 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TrabdQ99JY4 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TrabdQ99JY4 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TrabdQ99JY4 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TrabdQ99JY4 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
TrabdQ99JY4 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
TrabdQ99JY4 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
TrabdQ99JY4 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TrabdQ99JY4 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TrabdQ99JY4 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TrabdQ99JY4 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TrabdQ99JY4 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TrabdQ99JY4 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TrabdQ99JY4 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TrabdQ99JY4 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
TrabdQ99JY4 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TrabdQ99JY4 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TrabdQ99JY4 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TrabdQ99JY4 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TrabdQ99JY4 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TrabdQ99JY4 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TrabdQ99JY4 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TrabdQ99JY4 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TrabdQ99JY4 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TrabdQ99JY4 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TrabdQ99JY4 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TrabdQ99JY4 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TrabdQ99JY4 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TrabdQ99JY4 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
TrabdQ99JY4 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TrabdQ99JY4 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TrabdQ99JY4 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TrabdQ99JY4 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TrabdQ99JY4 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TrabdQ99JY4 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TrabdQ99JY4 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TrabdQ99JY4 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TrabdQ99JY4 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TrabdQ99JY4 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TrabdQ99JY4 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TrabdQ99JY4 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TrabdQ99JY4 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TrabdQ99JY4 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TrabdQ99JY4 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TrabdQ99JY4 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TrabdQ99JY4 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
TrabdQ99JY4 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TrabdQ99JY4 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TrabdQ99JY4 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
TrabdQ99JY4 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TrabdQ99JY4 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TrabdQ99JY4 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TrabdQ99JY4 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TrabdQ99JY4 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TrabdQ99JY4 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TrabdQ99JY4 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TrabdQ99JY4 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TrabdQ99JY4 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TrabdQ99JY4 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TrabdQ99JY4 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TrabdQ99JY4 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TrabdQ99JY4 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TrabdQ99JY4 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TrabdQ99JY4 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TrabdQ99JY4 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TrabdQ99JY4 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TrabdQ99JY4 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
TrabdQ99JY4 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TrabdQ99JY4 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
TrabdQ99JY4 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TrabdQ99JY4 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TrabdQ99JY4 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TrabdQ99JY4 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TrabdQ99JY4 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TrabdQ99JY4 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TrabdQ99JY4 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TrabdQ99JY4 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TrabdQ99JY4 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TrabdQ99JY4 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TrabdQ99JY4 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TrabdQ99JY4 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
TrabdQ99JY4 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TrabdQ99JY4 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TrabdQ99JY4 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TrabdQ99JY4 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TrabdQ99JY4 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TrabdQ99JY4 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TrabdQ99JY4 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TrabdQ99JY4 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TrabdQ99JY4 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TrabdQ99JY4 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TrabdQ99JY4 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TrabdQ99JY4 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
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