Protein–RNA interactions for Protein: Q99JX1

Taf11, Transcription initiation factor TFIID subunit 11, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf11Q99JX1 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Taf11Q99JX1 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Taf11Q99JX1 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Taf11Q99JX1 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Taf11Q99JX1 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Taf11Q99JX1 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Taf11Q99JX1 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Taf11Q99JX1 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Taf11Q99JX1 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Taf11Q99JX1 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Taf11Q99JX1 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Taf11Q99JX1 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Taf11Q99JX1 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Taf11Q99JX1 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Taf11Q99JX1 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Taf11Q99JX1 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Taf11Q99JX1 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Taf11Q99JX1 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Taf11Q99JX1 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Taf11Q99JX1 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Taf11Q99JX1 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Taf11Q99JX1 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Taf11Q99JX1 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Taf11Q99JX1 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Taf11Q99JX1 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Taf11Q99JX1 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Taf11Q99JX1 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Taf11Q99JX1 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Taf11Q99JX1 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Taf11Q99JX1 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Taf11Q99JX1 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Taf11Q99JX1 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Taf11Q99JX1 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Taf11Q99JX1 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Taf11Q99JX1 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Taf11Q99JX1 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Taf11Q99JX1 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Taf11Q99JX1 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Taf11Q99JX1 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Taf11Q99JX1 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Taf11Q99JX1 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Taf11Q99JX1 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Taf11Q99JX1 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Taf11Q99JX1 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Taf11Q99JX1 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Taf11Q99JX1 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Taf11Q99JX1 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Taf11Q99JX1 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Taf11Q99JX1 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Taf11Q99JX1 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Taf11Q99JX1 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Taf11Q99JX1 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Taf11Q99JX1 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Taf11Q99JX1 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Taf11Q99JX1 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Taf11Q99JX1 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Taf11Q99JX1 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Taf11Q99JX1 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Taf11Q99JX1 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Taf11Q99JX1 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Taf11Q99JX1 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Taf11Q99JX1 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Taf11Q99JX1 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Taf11Q99JX1 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Taf11Q99JX1 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Taf11Q99JX1 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Taf11Q99JX1 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Taf11Q99JX1 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Taf11Q99JX1 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Taf11Q99JX1 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Taf11Q99JX1 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Taf11Q99JX1 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Taf11Q99JX1 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Taf11Q99JX1 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Taf11Q99JX1 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Taf11Q99JX1 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Taf11Q99JX1 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Taf11Q99JX1 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Taf11Q99JX1 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Taf11Q99JX1 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Taf11Q99JX1 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Taf11Q99JX1 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Taf11Q99JX1 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Taf11Q99JX1 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Taf11Q99JX1 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Taf11Q99JX1 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Taf11Q99JX1 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Taf11Q99JX1 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Taf11Q99JX1 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Taf11Q99JX1 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Taf11Q99JX1 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Taf11Q99JX1 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Taf11Q99JX1 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Taf11Q99JX1 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Taf11Q99JX1 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Taf11Q99JX1 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Taf11Q99JX1 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Taf11Q99JX1 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Taf11Q99JX1 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Taf11Q99JX1 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms