Protein–RNA interactions for Protein: Q99J78

Def8, Differentially expressed in FDCP 8, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Def8Q99J78 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Def8Q99J78 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Def8Q99J78 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Def8Q99J78 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Def8Q99J78 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Def8Q99J78 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Def8Q99J78 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Def8Q99J78 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Def8Q99J78 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Def8Q99J78 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Def8Q99J78 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Def8Q99J78 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Def8Q99J78 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Def8Q99J78 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Def8Q99J78 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Def8Q99J78 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Def8Q99J78 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Def8Q99J78 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Def8Q99J78 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Def8Q99J78 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Def8Q99J78 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Def8Q99J78 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Def8Q99J78 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Def8Q99J78 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Def8Q99J78 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Def8Q99J78 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Def8Q99J78 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Def8Q99J78 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Def8Q99J78 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Def8Q99J78 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Def8Q99J78 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Def8Q99J78 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Def8Q99J78 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Def8Q99J78 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Def8Q99J78 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Def8Q99J78 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Def8Q99J78 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Def8Q99J78 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Def8Q99J78 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Def8Q99J78 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Def8Q99J78 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Def8Q99J78 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Def8Q99J78 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Def8Q99J78 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Def8Q99J78 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Def8Q99J78 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Def8Q99J78 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Def8Q99J78 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Def8Q99J78 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Def8Q99J78 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Def8Q99J78 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Def8Q99J78 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Def8Q99J78 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Def8Q99J78 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Def8Q99J78 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Def8Q99J78 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Def8Q99J78 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Def8Q99J78 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Def8Q99J78 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Def8Q99J78 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Def8Q99J78 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Def8Q99J78 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Def8Q99J78 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Def8Q99J78 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Def8Q99J78 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Def8Q99J78 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Def8Q99J78 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Def8Q99J78 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Def8Q99J78 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Def8Q99J78 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Def8Q99J78 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Def8Q99J78 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Def8Q99J78 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Def8Q99J78 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Def8Q99J78 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Def8Q99J78 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Def8Q99J78 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Def8Q99J78 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Def8Q99J78 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Def8Q99J78 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Def8Q99J78 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Def8Q99J78 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Def8Q99J78 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Def8Q99J78 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Def8Q99J78 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Def8Q99J78 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Def8Q99J78 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Def8Q99J78 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Def8Q99J78 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Def8Q99J78 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Def8Q99J78 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Def8Q99J78 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Def8Q99J78 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Def8Q99J78 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Def8Q99J78 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Def8Q99J78 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Def8Q99J78 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Def8Q99J78 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Def8Q99J78 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Def8Q99J78 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms