Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Apobec3Q99J72 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Apobec3Q99J72 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Apobec3Q99J72 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Apobec3Q99J72 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Apobec3Q99J72 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Apobec3Q99J72 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Apobec3Q99J72 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Apobec3Q99J72 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Apobec3Q99J72 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Apobec3Q99J72 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Apobec3Q99J72 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Apobec3Q99J72 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Apobec3Q99J72 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Apobec3Q99J72 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Apobec3Q99J72 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Apobec3Q99J72 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Apobec3Q99J72 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Apobec3Q99J72 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Apobec3Q99J72 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Apobec3Q99J72 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Apobec3Q99J72 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Apobec3Q99J72 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Apobec3Q99J72 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Apobec3Q99J72 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Apobec3Q99J72 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Apobec3Q99J72 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Apobec3Q99J72 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Apobec3Q99J72 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Apobec3Q99J72 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Apobec3Q99J72 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Apobec3Q99J72 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Apobec3Q99J72 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Apobec3Q99J72 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Apobec3Q99J72 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Apobec3Q99J72 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Apobec3Q99J72 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Apobec3Q99J72 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Apobec3Q99J72 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Apobec3Q99J72 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Apobec3Q99J72 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Apobec3Q99J72 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Apobec3Q99J72 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Apobec3Q99J72 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Apobec3Q99J72 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Apobec3Q99J72 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Apobec3Q99J72 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Apobec3Q99J72 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Apobec3Q99J72 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Apobec3Q99J72 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Apobec3Q99J72 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Apobec3Q99J72 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Apobec3Q99J72 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Apobec3Q99J72 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Apobec3Q99J72 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Apobec3Q99J72 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Apobec3Q99J72 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Apobec3Q99J72 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Apobec3Q99J72 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Apobec3Q99J72 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Apobec3Q99J72 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Apobec3Q99J72 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Apobec3Q99J72 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Apobec3Q99J72 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Apobec3Q99J72 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Apobec3Q99J72 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Apobec3Q99J72 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Apobec3Q99J72 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Apobec3Q99J72 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Apobec3Q99J72 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Apobec3Q99J72 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Apobec3Q99J72 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Apobec3Q99J72 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Apobec3Q99J72 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Apobec3Q99J72 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Apobec3Q99J72 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Apobec3Q99J72 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Apobec3Q99J72 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Apobec3Q99J72 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Apobec3Q99J72 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Apobec3Q99J72 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Apobec3Q99J72 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Apobec3Q99J72 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Apobec3Q99J72 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Apobec3Q99J72 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Apobec3Q99J72 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Apobec3Q99J72 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Apobec3Q99J72 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Apobec3Q99J72 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Apobec3Q99J72 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Apobec3Q99J72 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Apobec3Q99J72 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Apobec3Q99J72 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Apobec3Q99J72 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Apobec3Q99J72 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Apobec3Q99J72 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Apobec3Q99J72 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Apobec3Q99J72 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Apobec3Q99J72 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Apobec3Q99J72 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms