Protein–RNA interactions for Protein: Q99J59

Tspan1, Tetraspanin-1, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan1Q99J59 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tspan1Q99J59 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tspan1Q99J59 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Tspan1Q99J59 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tspan1Q99J59 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tspan1Q99J59 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tspan1Q99J59 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tspan1Q99J59 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tspan1Q99J59 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tspan1Q99J59 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tspan1Q99J59 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tspan1Q99J59 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tspan1Q99J59 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tspan1Q99J59 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tspan1Q99J59 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tspan1Q99J59 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tspan1Q99J59 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tspan1Q99J59 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tspan1Q99J59 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tspan1Q99J59 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tspan1Q99J59 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tspan1Q99J59 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tspan1Q99J59 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tspan1Q99J59 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tspan1Q99J59 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tspan1Q99J59 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tspan1Q99J59 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tspan1Q99J59 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tspan1Q99J59 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tspan1Q99J59 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tspan1Q99J59 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tspan1Q99J59 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tspan1Q99J59 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tspan1Q99J59 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tspan1Q99J59 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tspan1Q99J59 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tspan1Q99J59 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tspan1Q99J59 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tspan1Q99J59 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tspan1Q99J59 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tspan1Q99J59 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tspan1Q99J59 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tspan1Q99J59 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tspan1Q99J59 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tspan1Q99J59 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tspan1Q99J59 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tspan1Q99J59 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tspan1Q99J59 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tspan1Q99J59 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tspan1Q99J59 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tspan1Q99J59 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tspan1Q99J59 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tspan1Q99J59 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tspan1Q99J59 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tspan1Q99J59 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tspan1Q99J59 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tspan1Q99J59 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tspan1Q99J59 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tspan1Q99J59 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tspan1Q99J59 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tspan1Q99J59 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tspan1Q99J59 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tspan1Q99J59 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tspan1Q99J59 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tspan1Q99J59 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tspan1Q99J59 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tspan1Q99J59 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tspan1Q99J59 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tspan1Q99J59 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tspan1Q99J59 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tspan1Q99J59 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tspan1Q99J59 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tspan1Q99J59 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tspan1Q99J59 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tspan1Q99J59 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tspan1Q99J59 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tspan1Q99J59 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tspan1Q99J59 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tspan1Q99J59 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tspan1Q99J59 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tspan1Q99J59 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tspan1Q99J59 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tspan1Q99J59 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tspan1Q99J59 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tspan1Q99J59 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tspan1Q99J59 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tspan1Q99J59 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tspan1Q99J59 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tspan1Q99J59 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tspan1Q99J59 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tspan1Q99J59 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tspan1Q99J59 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tspan1Q99J59 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tspan1Q99J59 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tspan1Q99J59 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tspan1Q99J59 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tspan1Q99J59 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tspan1Q99J59 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tspan1Q99J59 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tspan1Q99J59 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms