Protein–RNA interactions for Protein: Q99J25

Mrm1, rRNA methyltransferase 1, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrm1Q99J25 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mrm1Q99J25 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mrm1Q99J25 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mrm1Q99J25 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mrm1Q99J25 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mrm1Q99J25 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mrm1Q99J25 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mrm1Q99J25 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mrm1Q99J25 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mrm1Q99J25 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mrm1Q99J25 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mrm1Q99J25 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mrm1Q99J25 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mrm1Q99J25 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mrm1Q99J25 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mrm1Q99J25 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Mrm1Q99J25 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Mrm1Q99J25 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mrm1Q99J25 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mrm1Q99J25 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Mrm1Q99J25 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mrm1Q99J25 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mrm1Q99J25 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mrm1Q99J25 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mrm1Q99J25 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mrm1Q99J25 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mrm1Q99J25 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mrm1Q99J25 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrm1Q99J25 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrm1Q99J25 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrm1Q99J25 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrm1Q99J25 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrm1Q99J25 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrm1Q99J25 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrm1Q99J25 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrm1Q99J25 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrm1Q99J25 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrm1Q99J25 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrm1Q99J25 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrm1Q99J25 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrm1Q99J25 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrm1Q99J25 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrm1Q99J25 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrm1Q99J25 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrm1Q99J25 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrm1Q99J25 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrm1Q99J25 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrm1Q99J25 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrm1Q99J25 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrm1Q99J25 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrm1Q99J25 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrm1Q99J25 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrm1Q99J25 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrm1Q99J25 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrm1Q99J25 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrm1Q99J25 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrm1Q99J25 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrm1Q99J25 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrm1Q99J25 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrm1Q99J25 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrm1Q99J25 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrm1Q99J25 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrm1Q99J25 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrm1Q99J25 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrm1Q99J25 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrm1Q99J25 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrm1Q99J25 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrm1Q99J25 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrm1Q99J25 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrm1Q99J25 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrm1Q99J25 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrm1Q99J25 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrm1Q99J25 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrm1Q99J25 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrm1Q99J25 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrm1Q99J25 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrm1Q99J25 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrm1Q99J25 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrm1Q99J25 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrm1Q99J25 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrm1Q99J25 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrm1Q99J25 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrm1Q99J25 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrm1Q99J25 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrm1Q99J25 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrm1Q99J25 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrm1Q99J25 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrm1Q99J25 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrm1Q99J25 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrm1Q99J25 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrm1Q99J25 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrm1Q99J25 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrm1Q99J25 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mrm1Q99J25 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mrm1Q99J25 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mrm1Q99J25 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mrm1Q99J25 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mrm1Q99J25 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mrm1Q99J25 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mrm1Q99J25 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms