Protein–RNA interactions for Protein: Q99J10

Ctu1, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctu1Q99J10 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Ctu1Q99J10 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Ctu1Q99J10 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ctu1Q99J10 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ctu1Q99J10 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ctu1Q99J10 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ctu1Q99J10 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ctu1Q99J10 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ctu1Q99J10 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ctu1Q99J10 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ctu1Q99J10 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ctu1Q99J10 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ctu1Q99J10 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ctu1Q99J10 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ctu1Q99J10 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ctu1Q99J10 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ctu1Q99J10 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ctu1Q99J10 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ctu1Q99J10 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ctu1Q99J10 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ctu1Q99J10 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ctu1Q99J10 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ctu1Q99J10 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Ctu1Q99J10 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ctu1Q99J10 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ctu1Q99J10 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ctu1Q99J10 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ctu1Q99J10 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ctu1Q99J10 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ctu1Q99J10 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ctu1Q99J10 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ctu1Q99J10 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ctu1Q99J10 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ctu1Q99J10 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ctu1Q99J10 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ctu1Q99J10 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ctu1Q99J10 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ctu1Q99J10 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ctu1Q99J10 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ctu1Q99J10 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ctu1Q99J10 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ctu1Q99J10 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ctu1Q99J10 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ctu1Q99J10 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ctu1Q99J10 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ctu1Q99J10 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ctu1Q99J10 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ctu1Q99J10 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ctu1Q99J10 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ctu1Q99J10 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ctu1Q99J10 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ctu1Q99J10 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ctu1Q99J10 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ctu1Q99J10 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ctu1Q99J10 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ctu1Q99J10 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ctu1Q99J10 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ctu1Q99J10 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ctu1Q99J10 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ctu1Q99J10 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Ctu1Q99J10 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ctu1Q99J10 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ctu1Q99J10 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ctu1Q99J10 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ctu1Q99J10 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ctu1Q99J10 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ctu1Q99J10 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Ctu1Q99J10 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Ctu1Q99J10 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ctu1Q99J10 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ctu1Q99J10 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ctu1Q99J10 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ctu1Q99J10 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ctu1Q99J10 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ctu1Q99J10 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ctu1Q99J10 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ctu1Q99J10 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ctu1Q99J10 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ctu1Q99J10 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ctu1Q99J10 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ctu1Q99J10 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ctu1Q99J10 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ctu1Q99J10 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ctu1Q99J10 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ctu1Q99J10 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ctu1Q99J10 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ctu1Q99J10 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ctu1Q99J10 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ctu1Q99J10 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ctu1Q99J10 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ctu1Q99J10 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ctu1Q99J10 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ctu1Q99J10 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ctu1Q99J10 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ctu1Q99J10 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ctu1Q99J10 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ctu1Q99J10 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ctu1Q99J10 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ctu1Q99J10 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ctu1Q99J10 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms