Protein–RNA interactions for Protein: Q923K4

Gtpbp3, tRNA modification GTPase GTPBP3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp3Q923K4 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gtpbp3Q923K4 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gtpbp3Q923K4 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gtpbp3Q923K4 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gtpbp3Q923K4 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Gtpbp3Q923K4 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gtpbp3Q923K4 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Gtpbp3Q923K4 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gtpbp3Q923K4 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gtpbp3Q923K4 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gtpbp3Q923K4 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gtpbp3Q923K4 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gtpbp3Q923K4 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gtpbp3Q923K4 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gtpbp3Q923K4 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gtpbp3Q923K4 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gtpbp3Q923K4 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gtpbp3Q923K4 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gtpbp3Q923K4 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gtpbp3Q923K4 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gtpbp3Q923K4 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Gtpbp3Q923K4 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gtpbp3Q923K4 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gtpbp3Q923K4 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gtpbp3Q923K4 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gtpbp3Q923K4 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gtpbp3Q923K4 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gtpbp3Q923K4 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gtpbp3Q923K4 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gtpbp3Q923K4 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gtpbp3Q923K4 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gtpbp3Q923K4 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gtpbp3Q923K4 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gtpbp3Q923K4 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Gtpbp3Q923K4 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gtpbp3Q923K4 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gtpbp3Q923K4 Gm43356-201ENSMUST00000196582 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gtpbp3Q923K4 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gtpbp3Q923K4 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gtpbp3Q923K4 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gtpbp3Q923K4 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gtpbp3Q923K4 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gtpbp3Q923K4 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gtpbp3Q923K4 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gtpbp3Q923K4 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gtpbp3Q923K4 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gtpbp3Q923K4 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gtpbp3Q923K4 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gtpbp3Q923K4 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gtpbp3Q923K4 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gtpbp3Q923K4 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gtpbp3Q923K4 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gtpbp3Q923K4 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gtpbp3Q923K4 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gtpbp3Q923K4 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gtpbp3Q923K4 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gtpbp3Q923K4 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gtpbp3Q923K4 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Gtpbp3Q923K4 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gtpbp3Q923K4 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Gtpbp3Q923K4 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Gtpbp3Q923K4 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Gtpbp3Q923K4 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Gtpbp3Q923K4 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gtpbp3Q923K4 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gtpbp3Q923K4 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Gtpbp3Q923K4 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gtpbp3Q923K4 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gtpbp3Q923K4 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gtpbp3Q923K4 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gtpbp3Q923K4 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gtpbp3Q923K4 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gtpbp3Q923K4 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gtpbp3Q923K4 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gtpbp3Q923K4 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gtpbp3Q923K4 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gtpbp3Q923K4 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gtpbp3Q923K4 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gtpbp3Q923K4 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gtpbp3Q923K4 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Gtpbp3Q923K4 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gtpbp3Q923K4 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gtpbp3Q923K4 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gtpbp3Q923K4 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gtpbp3Q923K4 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gtpbp3Q923K4 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gtpbp3Q923K4 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gtpbp3Q923K4 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gtpbp3Q923K4 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gtpbp3Q923K4 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gtpbp3Q923K4 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Gtpbp3Q923K4 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gtpbp3Q923K4 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gtpbp3Q923K4 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gtpbp3Q923K4 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gtpbp3Q923K4 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gtpbp3Q923K4 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gtpbp3Q923K4 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gtpbp3Q923K4 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gtpbp3Q923K4 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms