Protein–RNA interactions for Protein: Q922Y2

Trim59, Tripartite motif-containing protein 59, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim59Q922Y2 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trim59Q922Y2 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trim59Q922Y2 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trim59Q922Y2 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trim59Q922Y2 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trim59Q922Y2 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trim59Q922Y2 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trim59Q922Y2 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trim59Q922Y2 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trim59Q922Y2 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trim59Q922Y2 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trim59Q922Y2 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trim59Q922Y2 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trim59Q922Y2 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trim59Q922Y2 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trim59Q922Y2 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trim59Q922Y2 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trim59Q922Y2 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trim59Q922Y2 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trim59Q922Y2 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trim59Q922Y2 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trim59Q922Y2 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trim59Q922Y2 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trim59Q922Y2 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trim59Q922Y2 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trim59Q922Y2 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trim59Q922Y2 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trim59Q922Y2 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trim59Q922Y2 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trim59Q922Y2 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Trim59Q922Y2 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trim59Q922Y2 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trim59Q922Y2 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Trim59Q922Y2 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trim59Q922Y2 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trim59Q922Y2 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trim59Q922Y2 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trim59Q922Y2 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trim59Q922Y2 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trim59Q922Y2 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trim59Q922Y2 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trim59Q922Y2 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trim59Q922Y2 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trim59Q922Y2 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trim59Q922Y2 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trim59Q922Y2 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trim59Q922Y2 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trim59Q922Y2 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Trim59Q922Y2 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trim59Q922Y2 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Trim59Q922Y2 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trim59Q922Y2 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trim59Q922Y2 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trim59Q922Y2 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trim59Q922Y2 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trim59Q922Y2 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trim59Q922Y2 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trim59Q922Y2 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trim59Q922Y2 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trim59Q922Y2 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trim59Q922Y2 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trim59Q922Y2 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Trim59Q922Y2 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trim59Q922Y2 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trim59Q922Y2 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trim59Q922Y2 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trim59Q922Y2 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Trim59Q922Y2 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Trim59Q922Y2 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Trim59Q922Y2 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trim59Q922Y2 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trim59Q922Y2 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trim59Q922Y2 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Trim59Q922Y2 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Trim59Q922Y2 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Trim59Q922Y2 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Trim59Q922Y2 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Trim59Q922Y2 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim59Q922Y2 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim59Q922Y2 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim59Q922Y2 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim59Q922Y2 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim59Q922Y2 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim59Q922Y2 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim59Q922Y2 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim59Q922Y2 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim59Q922Y2 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim59Q922Y2 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim59Q922Y2 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim59Q922Y2 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim59Q922Y2 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim59Q922Y2 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim59Q922Y2 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim59Q922Y2 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim59Q922Y2 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim59Q922Y2 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim59Q922Y2 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim59Q922Y2 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim59Q922Y2 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim59Q922Y2 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms