Protein–RNA interactions for Protein: Q922J3

Clip1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip1Q922J3 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Clip1Q922J3 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Clip1Q922J3 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Clip1Q922J3 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Clip1Q922J3 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Clip1Q922J3 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Clip1Q922J3 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Clip1Q922J3 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Clip1Q922J3 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Clip1Q922J3 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Clip1Q922J3 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Clip1Q922J3 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Clip1Q922J3 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Clip1Q922J3 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Clip1Q922J3 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Clip1Q922J3 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Clip1Q922J3 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Clip1Q922J3 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Clip1Q922J3 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Clip1Q922J3 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Clip1Q922J3 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Clip1Q922J3 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Clip1Q922J3 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Clip1Q922J3 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Clip1Q922J3 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Clip1Q922J3 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Clip1Q922J3 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Clip1Q922J3 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Clip1Q922J3 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Clip1Q922J3 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Clip1Q922J3 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Clip1Q922J3 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Clip1Q922J3 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Clip1Q922J3 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Clip1Q922J3 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Clip1Q922J3 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Clip1Q922J3 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Clip1Q922J3 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Clip1Q922J3 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Clip1Q922J3 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Clip1Q922J3 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Clip1Q922J3 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Clip1Q922J3 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Clip1Q922J3 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Clip1Q922J3 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Clip1Q922J3 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Clip1Q922J3 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Clip1Q922J3 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Clip1Q922J3 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Clip1Q922J3 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Clip1Q922J3 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Clip1Q922J3 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Clip1Q922J3 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Clip1Q922J3 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Clip1Q922J3 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Clip1Q922J3 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Clip1Q922J3 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Clip1Q922J3 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Clip1Q922J3 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Clip1Q922J3 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Clip1Q922J3 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Clip1Q922J3 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Clip1Q922J3 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Clip1Q922J3 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Clip1Q922J3 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Clip1Q922J3 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Clip1Q922J3 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Clip1Q922J3 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Clip1Q922J3 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Clip1Q922J3 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Clip1Q922J3 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Clip1Q922J3 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Clip1Q922J3 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Clip1Q922J3 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Clip1Q922J3 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Clip1Q922J3 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Clip1Q922J3 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Clip1Q922J3 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Clip1Q922J3 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Clip1Q922J3 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Clip1Q922J3 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Clip1Q922J3 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Clip1Q922J3 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Clip1Q922J3 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Clip1Q922J3 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Clip1Q922J3 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Clip1Q922J3 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Clip1Q922J3 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Clip1Q922J3 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Clip1Q922J3 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Clip1Q922J3 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Clip1Q922J3 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Clip1Q922J3 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Clip1Q922J3 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Clip1Q922J3 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Clip1Q922J3 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Clip1Q922J3 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Clip1Q922J3 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Clip1Q922J3 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Clip1Q922J3 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms