Protein–RNA interactions for Protein: Q921F2

Tardbp, TAR DNA-binding protein 43, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TardbpQ921F2 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TardbpQ921F2 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TardbpQ921F2 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TardbpQ921F2 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TardbpQ921F2 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TardbpQ921F2 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TardbpQ921F2 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TardbpQ921F2 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TardbpQ921F2 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TardbpQ921F2 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TardbpQ921F2 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TardbpQ921F2 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TardbpQ921F2 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TardbpQ921F2 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TardbpQ921F2 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TardbpQ921F2 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TardbpQ921F2 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TardbpQ921F2 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TardbpQ921F2 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TardbpQ921F2 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TardbpQ921F2 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TardbpQ921F2 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TardbpQ921F2 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TardbpQ921F2 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
TardbpQ921F2 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TardbpQ921F2 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TardbpQ921F2 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TardbpQ921F2 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TardbpQ921F2 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TardbpQ921F2 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TardbpQ921F2 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TardbpQ921F2 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TardbpQ921F2 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TardbpQ921F2 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TardbpQ921F2 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TardbpQ921F2 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TardbpQ921F2 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TardbpQ921F2 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TardbpQ921F2 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TardbpQ921F2 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TardbpQ921F2 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TardbpQ921F2 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TardbpQ921F2 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TardbpQ921F2 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TardbpQ921F2 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TardbpQ921F2 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TardbpQ921F2 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TardbpQ921F2 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TardbpQ921F2 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TardbpQ921F2 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TardbpQ921F2 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TardbpQ921F2 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TardbpQ921F2 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TardbpQ921F2 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TardbpQ921F2 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TardbpQ921F2 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TardbpQ921F2 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TardbpQ921F2 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TardbpQ921F2 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TardbpQ921F2 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TardbpQ921F2 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TardbpQ921F2 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TardbpQ921F2 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TardbpQ921F2 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TardbpQ921F2 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TardbpQ921F2 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TardbpQ921F2 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TardbpQ921F2 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TardbpQ921F2 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TardbpQ921F2 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TardbpQ921F2 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TardbpQ921F2 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TardbpQ921F2 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TardbpQ921F2 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TardbpQ921F2 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TardbpQ921F2 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TardbpQ921F2 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TardbpQ921F2 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TardbpQ921F2 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TardbpQ921F2 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TardbpQ921F2 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TardbpQ921F2 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TardbpQ921F2 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TardbpQ921F2 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TardbpQ921F2 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TardbpQ921F2 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TardbpQ921F2 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TardbpQ921F2 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TardbpQ921F2 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TardbpQ921F2 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TardbpQ921F2 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TardbpQ921F2 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TardbpQ921F2 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TardbpQ921F2 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TardbpQ921F2 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TardbpQ921F2 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TardbpQ921F2 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TardbpQ921F2 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TardbpQ921F2 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TardbpQ921F2 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms