Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZQ5

Rpe65, Retinoid isomerohydrolase, mousemouse

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpe65Q91ZQ5 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rpe65Q91ZQ5 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rpe65Q91ZQ5 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rpe65Q91ZQ5 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rpe65Q91ZQ5 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rpe65Q91ZQ5 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rpe65Q91ZQ5 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rpe65Q91ZQ5 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rpe65Q91ZQ5 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rpe65Q91ZQ5 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rpe65Q91ZQ5 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rpe65Q91ZQ5 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rpe65Q91ZQ5 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rpe65Q91ZQ5 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rpe65Q91ZQ5 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rpe65Q91ZQ5 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rpe65Q91ZQ5 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rpe65Q91ZQ5 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rpe65Q91ZQ5 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rpe65Q91ZQ5 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rpe65Q91ZQ5 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Rpe65Q91ZQ5 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rpe65Q91ZQ5 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rpe65Q91ZQ5 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rpe65Q91ZQ5 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Rpe65Q91ZQ5 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rpe65Q91ZQ5 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rpe65Q91ZQ5 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rpe65Q91ZQ5 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rpe65Q91ZQ5 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rpe65Q91ZQ5 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rpe65Q91ZQ5 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rpe65Q91ZQ5 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rpe65Q91ZQ5 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rpe65Q91ZQ5 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rpe65Q91ZQ5 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rpe65Q91ZQ5 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rpe65Q91ZQ5 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rpe65Q91ZQ5 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rpe65Q91ZQ5 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rpe65Q91ZQ5 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rpe65Q91ZQ5 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rpe65Q91ZQ5 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rpe65Q91ZQ5 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rpe65Q91ZQ5 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rpe65Q91ZQ5 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rpe65Q91ZQ5 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rpe65Q91ZQ5 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rpe65Q91ZQ5 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rpe65Q91ZQ5 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rpe65Q91ZQ5 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rpe65Q91ZQ5 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rpe65Q91ZQ5 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rpe65Q91ZQ5 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rpe65Q91ZQ5 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rpe65Q91ZQ5 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rpe65Q91ZQ5 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rpe65Q91ZQ5 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rpe65Q91ZQ5 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rpe65Q91ZQ5 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rpe65Q91ZQ5 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rpe65Q91ZQ5 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rpe65Q91ZQ5 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rpe65Q91ZQ5 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rpe65Q91ZQ5 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rpe65Q91ZQ5 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rpe65Q91ZQ5 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rpe65Q91ZQ5 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rpe65Q91ZQ5 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rpe65Q91ZQ5 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rpe65Q91ZQ5 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Rpe65Q91ZQ5 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rpe65Q91ZQ5 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rpe65Q91ZQ5 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rpe65Q91ZQ5 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rpe65Q91ZQ5 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rpe65Q91ZQ5 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Rpe65Q91ZQ5 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rpe65Q91ZQ5 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rpe65Q91ZQ5 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rpe65Q91ZQ5 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rpe65Q91ZQ5 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rpe65Q91ZQ5 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rpe65Q91ZQ5 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rpe65Q91ZQ5 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rpe65Q91ZQ5 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rpe65Q91ZQ5 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rpe65Q91ZQ5 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rpe65Q91ZQ5 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rpe65Q91ZQ5 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rpe65Q91ZQ5 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rpe65Q91ZQ5 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rpe65Q91ZQ5 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rpe65Q91ZQ5 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rpe65Q91ZQ5 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rpe65Q91ZQ5 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rpe65Q91ZQ5 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rpe65Q91ZQ5 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rpe65Q91ZQ5 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rpe65Q91ZQ5 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms