Protein–RNA interactions for Protein: Q91Y07

Pcdhb12, MCG141300, mousemouse

Predictions only

Length 789 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdhb12Q91Y07 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pcdhb12Q91Y07 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pcdhb12Q91Y07 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pcdhb12Q91Y07 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pcdhb12Q91Y07 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pcdhb12Q91Y07 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pcdhb12Q91Y07 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pcdhb12Q91Y07 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pcdhb12Q91Y07 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pcdhb12Q91Y07 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Pcdhb12Q91Y07 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pcdhb12Q91Y07 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pcdhb12Q91Y07 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Pcdhb12Q91Y07 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Pcdhb12Q91Y07 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pcdhb12Q91Y07 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pcdhb12Q91Y07 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pcdhb12Q91Y07 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pcdhb12Q91Y07 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pcdhb12Q91Y07 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pcdhb12Q91Y07 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pcdhb12Q91Y07 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pcdhb12Q91Y07 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pcdhb12Q91Y07 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Pcdhb12Q91Y07 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Pcdhb12Q91Y07 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Pcdhb12Q91Y07 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Pcdhb12Q91Y07 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pcdhb12Q91Y07 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pcdhb12Q91Y07 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pcdhb12Q91Y07 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pcdhb12Q91Y07 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pcdhb12Q91Y07 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pcdhb12Q91Y07 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pcdhb12Q91Y07 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pcdhb12Q91Y07 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pcdhb12Q91Y07 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Pcdhb12Q91Y07 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pcdhb12Q91Y07 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pcdhb12Q91Y07 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pcdhb12Q91Y07 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pcdhb12Q91Y07 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pcdhb12Q91Y07 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pcdhb12Q91Y07 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pcdhb12Q91Y07 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pcdhb12Q91Y07 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pcdhb12Q91Y07 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pcdhb12Q91Y07 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pcdhb12Q91Y07 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pcdhb12Q91Y07 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pcdhb12Q91Y07 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pcdhb12Q91Y07 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pcdhb12Q91Y07 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pcdhb12Q91Y07 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pcdhb12Q91Y07 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pcdhb12Q91Y07 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pcdhb12Q91Y07 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pcdhb12Q91Y07 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pcdhb12Q91Y07 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pcdhb12Q91Y07 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Pcdhb12Q91Y07 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Pcdhb12Q91Y07 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pcdhb12Q91Y07 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pcdhb12Q91Y07 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pcdhb12Q91Y07 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pcdhb12Q91Y07 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pcdhb12Q91Y07 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pcdhb12Q91Y07 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pcdhb12Q91Y07 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pcdhb12Q91Y07 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pcdhb12Q91Y07 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pcdhb12Q91Y07 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pcdhb12Q91Y07 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pcdhb12Q91Y07 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pcdhb12Q91Y07 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pcdhb12Q91Y07 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pcdhb12Q91Y07 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pcdhb12Q91Y07 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pcdhb12Q91Y07 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pcdhb12Q91Y07 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pcdhb12Q91Y07 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pcdhb12Q91Y07 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pcdhb12Q91Y07 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pcdhb12Q91Y07 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pcdhb12Q91Y07 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pcdhb12Q91Y07 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pcdhb12Q91Y07 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pcdhb12Q91Y07 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pcdhb12Q91Y07 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pcdhb12Q91Y07 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pcdhb12Q91Y07 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pcdhb12Q91Y07 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pcdhb12Q91Y07 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pcdhb12Q91Y07 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pcdhb12Q91Y07 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pcdhb12Q91Y07 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pcdhb12Q91Y07 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pcdhb12Q91Y07 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pcdhb12Q91Y07 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pcdhb12Q91Y07 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms