Protein–RNA interactions for Protein: Q91WC7

Nipal2, NIPA-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipal2Q91WC7 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nipal2Q91WC7 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nipal2Q91WC7 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nipal2Q91WC7 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nipal2Q91WC7 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nipal2Q91WC7 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nipal2Q91WC7 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nipal2Q91WC7 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nipal2Q91WC7 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nipal2Q91WC7 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nipal2Q91WC7 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nipal2Q91WC7 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nipal2Q91WC7 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nipal2Q91WC7 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nipal2Q91WC7 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nipal2Q91WC7 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nipal2Q91WC7 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nipal2Q91WC7 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nipal2Q91WC7 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nipal2Q91WC7 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nipal2Q91WC7 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nipal2Q91WC7 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nipal2Q91WC7 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nipal2Q91WC7 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nipal2Q91WC7 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nipal2Q91WC7 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nipal2Q91WC7 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nipal2Q91WC7 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nipal2Q91WC7 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nipal2Q91WC7 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nipal2Q91WC7 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nipal2Q91WC7 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nipal2Q91WC7 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nipal2Q91WC7 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nipal2Q91WC7 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Nipal2Q91WC7 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Nipal2Q91WC7 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nipal2Q91WC7 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nipal2Q91WC7 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nipal2Q91WC7 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nipal2Q91WC7 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nipal2Q91WC7 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nipal2Q91WC7 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nipal2Q91WC7 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nipal2Q91WC7 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nipal2Q91WC7 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nipal2Q91WC7 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nipal2Q91WC7 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nipal2Q91WC7 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nipal2Q91WC7 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nipal2Q91WC7 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nipal2Q91WC7 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nipal2Q91WC7 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nipal2Q91WC7 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nipal2Q91WC7 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nipal2Q91WC7 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nipal2Q91WC7 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nipal2Q91WC7 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nipal2Q91WC7 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nipal2Q91WC7 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nipal2Q91WC7 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nipal2Q91WC7 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nipal2Q91WC7 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nipal2Q91WC7 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nipal2Q91WC7 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nipal2Q91WC7 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nipal2Q91WC7 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nipal2Q91WC7 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nipal2Q91WC7 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nipal2Q91WC7 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nipal2Q91WC7 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nipal2Q91WC7 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nipal2Q91WC7 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nipal2Q91WC7 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nipal2Q91WC7 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nipal2Q91WC7 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nipal2Q91WC7 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nipal2Q91WC7 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nipal2Q91WC7 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nipal2Q91WC7 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nipal2Q91WC7 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nipal2Q91WC7 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nipal2Q91WC7 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nipal2Q91WC7 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nipal2Q91WC7 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nipal2Q91WC7 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nipal2Q91WC7 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nipal2Q91WC7 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Nipal2Q91WC7 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nipal2Q91WC7 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nipal2Q91WC7 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nipal2Q91WC7 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nipal2Q91WC7 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nipal2Q91WC7 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nipal2Q91WC7 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Nipal2Q91WC7 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nipal2Q91WC7 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nipal2Q91WC7 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nipal2Q91WC7 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nipal2Q91WC7 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms