Protein–RNA interactions for Protein: Q91W50

Csde1, Cold shock domain-containing protein E1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csde1Q91W50 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Csde1Q91W50 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Csde1Q91W50 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Csde1Q91W50 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Csde1Q91W50 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Csde1Q91W50 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Csde1Q91W50 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Csde1Q91W50 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Csde1Q91W50 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Csde1Q91W50 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Csde1Q91W50 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Csde1Q91W50 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Csde1Q91W50 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Csde1Q91W50 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Csde1Q91W50 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Csde1Q91W50 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Csde1Q91W50 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Csde1Q91W50 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Csde1Q91W50 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Csde1Q91W50 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Csde1Q91W50 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Csde1Q91W50 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Csde1Q91W50 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Csde1Q91W50 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Csde1Q91W50 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Csde1Q91W50 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Csde1Q91W50 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Csde1Q91W50 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Csde1Q91W50 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Csde1Q91W50 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Csde1Q91W50 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Csde1Q91W50 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Csde1Q91W50 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Csde1Q91W50 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Csde1Q91W50 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Csde1Q91W50 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Csde1Q91W50 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Csde1Q91W50 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Csde1Q91W50 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Csde1Q91W50 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Csde1Q91W50 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Csde1Q91W50 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Csde1Q91W50 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Csde1Q91W50 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Csde1Q91W50 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Csde1Q91W50 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Csde1Q91W50 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Csde1Q91W50 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Csde1Q91W50 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Csde1Q91W50 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Csde1Q91W50 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Csde1Q91W50 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Csde1Q91W50 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Csde1Q91W50 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Csde1Q91W50 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Csde1Q91W50 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Csde1Q91W50 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Csde1Q91W50 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Csde1Q91W50 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Csde1Q91W50 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Csde1Q91W50 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Csde1Q91W50 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Csde1Q91W50 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Csde1Q91W50 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Csde1Q91W50 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Csde1Q91W50 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Csde1Q91W50 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Csde1Q91W50 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Csde1Q91W50 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Csde1Q91W50 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Csde1Q91W50 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Csde1Q91W50 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Csde1Q91W50 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Csde1Q91W50 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Csde1Q91W50 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Csde1Q91W50 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Csde1Q91W50 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Csde1Q91W50 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Csde1Q91W50 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Csde1Q91W50 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Csde1Q91W50 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Csde1Q91W50 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Csde1Q91W50 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Csde1Q91W50 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Csde1Q91W50 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Csde1Q91W50 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Csde1Q91W50 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Csde1Q91W50 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Csde1Q91W50 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Csde1Q91W50 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Csde1Q91W50 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Csde1Q91W50 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Csde1Q91W50 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Csde1Q91W50 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Csde1Q91W50 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Csde1Q91W50 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Csde1Q91W50 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Csde1Q91W50 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Csde1Q91W50 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Csde1Q91W50 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms