Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHC3

Selenom, Selenoprotein M, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelenomQ8VHC3 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SelenomQ8VHC3 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SelenomQ8VHC3 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SelenomQ8VHC3 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SelenomQ8VHC3 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SelenomQ8VHC3 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SelenomQ8VHC3 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SelenomQ8VHC3 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SelenomQ8VHC3 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SelenomQ8VHC3 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SelenomQ8VHC3 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SelenomQ8VHC3 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SelenomQ8VHC3 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SelenomQ8VHC3 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SelenomQ8VHC3 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SelenomQ8VHC3 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SelenomQ8VHC3 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SelenomQ8VHC3 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SelenomQ8VHC3 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SelenomQ8VHC3 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SelenomQ8VHC3 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SelenomQ8VHC3 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SelenomQ8VHC3 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SelenomQ8VHC3 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SelenomQ8VHC3 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SelenomQ8VHC3 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SelenomQ8VHC3 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SelenomQ8VHC3 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SelenomQ8VHC3 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SelenomQ8VHC3 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SelenomQ8VHC3 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SelenomQ8VHC3 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SelenomQ8VHC3 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SelenomQ8VHC3 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SelenomQ8VHC3 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SelenomQ8VHC3 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SelenomQ8VHC3 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SelenomQ8VHC3 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SelenomQ8VHC3 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SelenomQ8VHC3 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SelenomQ8VHC3 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SelenomQ8VHC3 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SelenomQ8VHC3 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SelenomQ8VHC3 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SelenomQ8VHC3 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SelenomQ8VHC3 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SelenomQ8VHC3 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SelenomQ8VHC3 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SelenomQ8VHC3 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SelenomQ8VHC3 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SelenomQ8VHC3 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SelenomQ8VHC3 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SelenomQ8VHC3 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SelenomQ8VHC3 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SelenomQ8VHC3 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SelenomQ8VHC3 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SelenomQ8VHC3 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SelenomQ8VHC3 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SelenomQ8VHC3 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SelenomQ8VHC3 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SelenomQ8VHC3 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SelenomQ8VHC3 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SelenomQ8VHC3 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SelenomQ8VHC3 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SelenomQ8VHC3 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SelenomQ8VHC3 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SelenomQ8VHC3 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SelenomQ8VHC3 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SelenomQ8VHC3 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SelenomQ8VHC3 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SelenomQ8VHC3 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SelenomQ8VHC3 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SelenomQ8VHC3 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SelenomQ8VHC3 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SelenomQ8VHC3 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SelenomQ8VHC3 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SelenomQ8VHC3 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SelenomQ8VHC3 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SelenomQ8VHC3 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SelenomQ8VHC3 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SelenomQ8VHC3 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SelenomQ8VHC3 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SelenomQ8VHC3 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SelenomQ8VHC3 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SelenomQ8VHC3 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SelenomQ8VHC3 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SelenomQ8VHC3 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SelenomQ8VHC3 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SelenomQ8VHC3 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SelenomQ8VHC3 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SelenomQ8VHC3 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SelenomQ8VHC3 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SelenomQ8VHC3 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SelenomQ8VHC3 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SelenomQ8VHC3 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SelenomQ8VHC3 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SelenomQ8VHC3 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SelenomQ8VHC3 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SelenomQ8VHC3 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SelenomQ8VHC3 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms