Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEJ9

Vps4a, Vacuolar protein sorting-associated protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps4aQ8VEJ9 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vps4aQ8VEJ9 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vps4aQ8VEJ9 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vps4aQ8VEJ9 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Vps4aQ8VEJ9 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vps4aQ8VEJ9 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vps4aQ8VEJ9 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vps4aQ8VEJ9 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vps4aQ8VEJ9 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Vps4aQ8VEJ9 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vps4aQ8VEJ9 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vps4aQ8VEJ9 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vps4aQ8VEJ9 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vps4aQ8VEJ9 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vps4aQ8VEJ9 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vps4aQ8VEJ9 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vps4aQ8VEJ9 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vps4aQ8VEJ9 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vps4aQ8VEJ9 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vps4aQ8VEJ9 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vps4aQ8VEJ9 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vps4aQ8VEJ9 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vps4aQ8VEJ9 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vps4aQ8VEJ9 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vps4aQ8VEJ9 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vps4aQ8VEJ9 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vps4aQ8VEJ9 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vps4aQ8VEJ9 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vps4aQ8VEJ9 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vps4aQ8VEJ9 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vps4aQ8VEJ9 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vps4aQ8VEJ9 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vps4aQ8VEJ9 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vps4aQ8VEJ9 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vps4aQ8VEJ9 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vps4aQ8VEJ9 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vps4aQ8VEJ9 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vps4aQ8VEJ9 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vps4aQ8VEJ9 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vps4aQ8VEJ9 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vps4aQ8VEJ9 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vps4aQ8VEJ9 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vps4aQ8VEJ9 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vps4aQ8VEJ9 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vps4aQ8VEJ9 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vps4aQ8VEJ9 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vps4aQ8VEJ9 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vps4aQ8VEJ9 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vps4aQ8VEJ9 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vps4aQ8VEJ9 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vps4aQ8VEJ9 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vps4aQ8VEJ9 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vps4aQ8VEJ9 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vps4aQ8VEJ9 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vps4aQ8VEJ9 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vps4aQ8VEJ9 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vps4aQ8VEJ9 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vps4aQ8VEJ9 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vps4aQ8VEJ9 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vps4aQ8VEJ9 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vps4aQ8VEJ9 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vps4aQ8VEJ9 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vps4aQ8VEJ9 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vps4aQ8VEJ9 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vps4aQ8VEJ9 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vps4aQ8VEJ9 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vps4aQ8VEJ9 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vps4aQ8VEJ9 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vps4aQ8VEJ9 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vps4aQ8VEJ9 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vps4aQ8VEJ9 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Vps4aQ8VEJ9 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vps4aQ8VEJ9 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vps4aQ8VEJ9 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vps4aQ8VEJ9 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Vps4aQ8VEJ9 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Vps4aQ8VEJ9 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vps4aQ8VEJ9 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vps4aQ8VEJ9 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Vps4aQ8VEJ9 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vps4aQ8VEJ9 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vps4aQ8VEJ9 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vps4aQ8VEJ9 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vps4aQ8VEJ9 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vps4aQ8VEJ9 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vps4aQ8VEJ9 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vps4aQ8VEJ9 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vps4aQ8VEJ9 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vps4aQ8VEJ9 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vps4aQ8VEJ9 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vps4aQ8VEJ9 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vps4aQ8VEJ9 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vps4aQ8VEJ9 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vps4aQ8VEJ9 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vps4aQ8VEJ9 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vps4aQ8VEJ9 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vps4aQ8VEJ9 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vps4aQ8VEJ9 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vps4aQ8VEJ9 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vps4aQ8VEJ9 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms