Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE18

Smg8, Protein SMG8, mousemouse

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Length 991 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg8Q8VE18 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Smg8Q8VE18 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Smg8Q8VE18 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Smg8Q8VE18 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Smg8Q8VE18 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Smg8Q8VE18 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Smg8Q8VE18 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Smg8Q8VE18 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Smg8Q8VE18 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Smg8Q8VE18 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Smg8Q8VE18 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Smg8Q8VE18 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Smg8Q8VE18 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Smg8Q8VE18 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Smg8Q8VE18 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Smg8Q8VE18 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Smg8Q8VE18 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Smg8Q8VE18 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Smg8Q8VE18 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Smg8Q8VE18 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Smg8Q8VE18 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Smg8Q8VE18 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Smg8Q8VE18 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Smg8Q8VE18 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Smg8Q8VE18 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Smg8Q8VE18 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Smg8Q8VE18 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Smg8Q8VE18 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Smg8Q8VE18 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Smg8Q8VE18 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Smg8Q8VE18 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Smg8Q8VE18 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Smg8Q8VE18 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Smg8Q8VE18 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Smg8Q8VE18 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Smg8Q8VE18 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Smg8Q8VE18 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Smg8Q8VE18 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Smg8Q8VE18 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Smg8Q8VE18 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Smg8Q8VE18 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Smg8Q8VE18 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Smg8Q8VE18 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Smg8Q8VE18 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Smg8Q8VE18 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Smg8Q8VE18 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Smg8Q8VE18 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Smg8Q8VE18 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Smg8Q8VE18 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Smg8Q8VE18 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Smg8Q8VE18 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Smg8Q8VE18 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Smg8Q8VE18 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Smg8Q8VE18 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Smg8Q8VE18 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Smg8Q8VE18 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Smg8Q8VE18 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Smg8Q8VE18 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smg8Q8VE18 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smg8Q8VE18 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smg8Q8VE18 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smg8Q8VE18 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smg8Q8VE18 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smg8Q8VE18 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smg8Q8VE18 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smg8Q8VE18 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
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Smg8Q8VE18 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smg8Q8VE18 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smg8Q8VE18 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smg8Q8VE18 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smg8Q8VE18 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smg8Q8VE18 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smg8Q8VE18 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smg8Q8VE18 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smg8Q8VE18 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smg8Q8VE18 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smg8Q8VE18 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Smg8Q8VE18 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smg8Q8VE18 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smg8Q8VE18 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smg8Q8VE18 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smg8Q8VE18 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smg8Q8VE18 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smg8Q8VE18 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Smg8Q8VE18 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smg8Q8VE18 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Smg8Q8VE18 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smg8Q8VE18 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smg8Q8VE18 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smg8Q8VE18 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smg8Q8VE18 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smg8Q8VE18 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smg8Q8VE18 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smg8Q8VE18 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smg8Q8VE18 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smg8Q8VE18 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smg8Q8VE18 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smg8Q8VE18 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smg8Q8VE18 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
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