Protein–RNA interactions for Protein: Q8VD57

Sft2d2, Vesicle transport protein SFT2B, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d2Q8VD57 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sft2d2Q8VD57 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sft2d2Q8VD57 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sft2d2Q8VD57 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sft2d2Q8VD57 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sft2d2Q8VD57 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sft2d2Q8VD57 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sft2d2Q8VD57 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sft2d2Q8VD57 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sft2d2Q8VD57 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sft2d2Q8VD57 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sft2d2Q8VD57 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sft2d2Q8VD57 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sft2d2Q8VD57 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sft2d2Q8VD57 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sft2d2Q8VD57 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sft2d2Q8VD57 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sft2d2Q8VD57 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sft2d2Q8VD57 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sft2d2Q8VD57 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sft2d2Q8VD57 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sft2d2Q8VD57 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sft2d2Q8VD57 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sft2d2Q8VD57 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sft2d2Q8VD57 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sft2d2Q8VD57 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sft2d2Q8VD57 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sft2d2Q8VD57 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sft2d2Q8VD57 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sft2d2Q8VD57 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sft2d2Q8VD57 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sft2d2Q8VD57 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sft2d2Q8VD57 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sft2d2Q8VD57 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sft2d2Q8VD57 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sft2d2Q8VD57 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sft2d2Q8VD57 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sft2d2Q8VD57 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sft2d2Q8VD57 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sft2d2Q8VD57 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sft2d2Q8VD57 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sft2d2Q8VD57 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sft2d2Q8VD57 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sft2d2Q8VD57 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sft2d2Q8VD57 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sft2d2Q8VD57 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sft2d2Q8VD57 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sft2d2Q8VD57 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sft2d2Q8VD57 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sft2d2Q8VD57 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sft2d2Q8VD57 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sft2d2Q8VD57 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sft2d2Q8VD57 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sft2d2Q8VD57 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sft2d2Q8VD57 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sft2d2Q8VD57 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sft2d2Q8VD57 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sft2d2Q8VD57 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sft2d2Q8VD57 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sft2d2Q8VD57 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sft2d2Q8VD57 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sft2d2Q8VD57 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sft2d2Q8VD57 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sft2d2Q8VD57 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sft2d2Q8VD57 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sft2d2Q8VD57 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sft2d2Q8VD57 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sft2d2Q8VD57 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sft2d2Q8VD57 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sft2d2Q8VD57 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sft2d2Q8VD57 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sft2d2Q8VD57 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sft2d2Q8VD57 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sft2d2Q8VD57 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sft2d2Q8VD57 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sft2d2Q8VD57 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sft2d2Q8VD57 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sft2d2Q8VD57 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sft2d2Q8VD57 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sft2d2Q8VD57 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sft2d2Q8VD57 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sft2d2Q8VD57 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sft2d2Q8VD57 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sft2d2Q8VD57 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sft2d2Q8VD57 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sft2d2Q8VD57 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sft2d2Q8VD57 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sft2d2Q8VD57 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sft2d2Q8VD57 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sft2d2Q8VD57 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sft2d2Q8VD57 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sft2d2Q8VD57 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sft2d2Q8VD57 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sft2d2Q8VD57 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sft2d2Q8VD57 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sft2d2Q8VD57 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sft2d2Q8VD57 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sft2d2Q8VD57 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Sft2d2Q8VD57 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sft2d2Q8VD57 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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