Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCS3

Fam20b, Glycosaminoglycan xylosylkinase, mousemouse

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Length 409 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam20bQ8VCS3 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fam20bQ8VCS3 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fam20bQ8VCS3 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fam20bQ8VCS3 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fam20bQ8VCS3 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fam20bQ8VCS3 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fam20bQ8VCS3 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fam20bQ8VCS3 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fam20bQ8VCS3 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fam20bQ8VCS3 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fam20bQ8VCS3 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fam20bQ8VCS3 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Fam20bQ8VCS3 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fam20bQ8VCS3 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fam20bQ8VCS3 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fam20bQ8VCS3 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fam20bQ8VCS3 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fam20bQ8VCS3 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fam20bQ8VCS3 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fam20bQ8VCS3 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fam20bQ8VCS3 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fam20bQ8VCS3 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fam20bQ8VCS3 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fam20bQ8VCS3 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fam20bQ8VCS3 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Fam20bQ8VCS3 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fam20bQ8VCS3 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fam20bQ8VCS3 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fam20bQ8VCS3 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fam20bQ8VCS3 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fam20bQ8VCS3 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fam20bQ8VCS3 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fam20bQ8VCS3 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fam20bQ8VCS3 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fam20bQ8VCS3 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fam20bQ8VCS3 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fam20bQ8VCS3 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fam20bQ8VCS3 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fam20bQ8VCS3 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fam20bQ8VCS3 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fam20bQ8VCS3 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fam20bQ8VCS3 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fam20bQ8VCS3 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fam20bQ8VCS3 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fam20bQ8VCS3 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fam20bQ8VCS3 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fam20bQ8VCS3 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fam20bQ8VCS3 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fam20bQ8VCS3 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fam20bQ8VCS3 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fam20bQ8VCS3 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fam20bQ8VCS3 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Fam20bQ8VCS3 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fam20bQ8VCS3 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fam20bQ8VCS3 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Fam20bQ8VCS3 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fam20bQ8VCS3 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Fam20bQ8VCS3 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Fam20bQ8VCS3 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fam20bQ8VCS3 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fam20bQ8VCS3 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fam20bQ8VCS3 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fam20bQ8VCS3 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Fam20bQ8VCS3 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Fam20bQ8VCS3 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Fam20bQ8VCS3 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fam20bQ8VCS3 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fam20bQ8VCS3 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fam20bQ8VCS3 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fam20bQ8VCS3 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fam20bQ8VCS3 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fam20bQ8VCS3 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fam20bQ8VCS3 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fam20bQ8VCS3 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fam20bQ8VCS3 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fam20bQ8VCS3 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fam20bQ8VCS3 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fam20bQ8VCS3 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fam20bQ8VCS3 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fam20bQ8VCS3 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Fam20bQ8VCS3 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fam20bQ8VCS3 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fam20bQ8VCS3 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fam20bQ8VCS3 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
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