Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCG9

Rfxap, Regulatory factor X-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RfxapQ8VCG9 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RfxapQ8VCG9 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RfxapQ8VCG9 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RfxapQ8VCG9 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RfxapQ8VCG9 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RfxapQ8VCG9 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RfxapQ8VCG9 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RfxapQ8VCG9 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RfxapQ8VCG9 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
RfxapQ8VCG9 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RfxapQ8VCG9 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
RfxapQ8VCG9 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RfxapQ8VCG9 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RfxapQ8VCG9 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RfxapQ8VCG9 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RfxapQ8VCG9 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RfxapQ8VCG9 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RfxapQ8VCG9 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
RfxapQ8VCG9 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RfxapQ8VCG9 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RfxapQ8VCG9 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RfxapQ8VCG9 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RfxapQ8VCG9 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RfxapQ8VCG9 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RfxapQ8VCG9 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RfxapQ8VCG9 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RfxapQ8VCG9 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RfxapQ8VCG9 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RfxapQ8VCG9 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RfxapQ8VCG9 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RfxapQ8VCG9 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RfxapQ8VCG9 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RfxapQ8VCG9 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RfxapQ8VCG9 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RfxapQ8VCG9 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RfxapQ8VCG9 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RfxapQ8VCG9 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RfxapQ8VCG9 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RfxapQ8VCG9 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RfxapQ8VCG9 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RfxapQ8VCG9 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RfxapQ8VCG9 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RfxapQ8VCG9 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RfxapQ8VCG9 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RfxapQ8VCG9 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RfxapQ8VCG9 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RfxapQ8VCG9 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RfxapQ8VCG9 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RfxapQ8VCG9 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RfxapQ8VCG9 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RfxapQ8VCG9 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RfxapQ8VCG9 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RfxapQ8VCG9 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RfxapQ8VCG9 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RfxapQ8VCG9 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RfxapQ8VCG9 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RfxapQ8VCG9 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RfxapQ8VCG9 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RfxapQ8VCG9 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RfxapQ8VCG9 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
RfxapQ8VCG9 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
RfxapQ8VCG9 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RfxapQ8VCG9 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RfxapQ8VCG9 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RfxapQ8VCG9 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RfxapQ8VCG9 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RfxapQ8VCG9 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RfxapQ8VCG9 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RfxapQ8VCG9 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RfxapQ8VCG9 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RfxapQ8VCG9 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RfxapQ8VCG9 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
RfxapQ8VCG9 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RfxapQ8VCG9 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RfxapQ8VCG9 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RfxapQ8VCG9 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RfxapQ8VCG9 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RfxapQ8VCG9 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RfxapQ8VCG9 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RfxapQ8VCG9 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RfxapQ8VCG9 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RfxapQ8VCG9 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RfxapQ8VCG9 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RfxapQ8VCG9 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RfxapQ8VCG9 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RfxapQ8VCG9 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RfxapQ8VCG9 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RfxapQ8VCG9 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RfxapQ8VCG9 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RfxapQ8VCG9 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RfxapQ8VCG9 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RfxapQ8VCG9 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RfxapQ8VCG9 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RfxapQ8VCG9 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RfxapQ8VCG9 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RfxapQ8VCG9 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RfxapQ8VCG9 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RfxapQ8VCG9 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RfxapQ8VCG9 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RfxapQ8VCG9 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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